我有两张表格A和B,它们分别包含病人体征和诊断记录。我需要找到表A中与表B中每个诊断时间最接近的体征,并将它们结合到一起。同时,它们都有一个共同的病人ID列。请问,在Python中该如何实现这个功能?是否有一些优化的解决方案呢?非常感谢!
import pandas as pd
df = pd.read_excel("234.xlsx",sheet_name=2)
print(df)
"""
#输出:
a b
0 1 10
1 2 20
"""
"a":lambda x:x.strip(), #去除列名a左右的空格
#将数据第1列都加上10,第2列乘以2倍
df = pd.read_excel("234.xlsx",sheet_name=2,
converters={
"a":lambda x:x+10, #a列加10
"b":lambda x:x*2, #b列乘以2倍
})
print(df)
"""
#输出:
a b
0 11 20
1 12 40
"""
import pandas as pd
#通过索引获取列的值和更改列的值
#还可以写成:df[(df["b"]>2) & (df["b"]<6)] 且关系
#还可以写成:df[(df["b"]==2) | (df["b"]==8)] 或关系
#还可以写成:df[~(df["b"]==2)] 不等于关系
df = pd.read_excel("234.xlsx",sheet_name=2)
print(df)
"""
#输出:
a b
0 1 10
1 2 20
"""
#判断b列值是否大于11
print(df["b"]>11)
"""
#输出:
0 False
1 True
Name: b, dtype: bool
"""
#显示b列值大于11的值
print(df[df["b"]>11])
"""
#输出:
a b
1 2 20
"""
#只显示b列的数值
print(df[["b"]])
"""
#输出:
b
0 10
1 20
"""
#只显示第1行,也就是True的那一行,这种带True,False的取值方式叫掩码取值
print(df[[True,False]])
"""
#输出:
a b
0 1 10
"""
#获取b列的数值,将b列值更改为101,201
df["b"] = [101,201]
print(df)
"""
#输出:
a b
0 1 101
1 2 201
"""
#修改a列和b列值
df[["a","b"]] = [[101,201],[202,203]]
print(df)
"""
#输出:
a b
0 101 201
1 202 203
"""
针对医疗数据匹配问题,可以通过以下步骤解决:
首先,读取表A和表B的数据,并将表A按照病人ID进行分组,将每个分组内的数据按照时间排序。
接着,遍历表B的数据,对于每一条数据,在表A中找到其病人ID对应的分组,并进行二分查找(或者其他高效搜索算法),找到表A中最靠近当前行数据时间的体征。
将表B中的数据和找到的表A中的体征进行结合。
具体实现代码如下:
import pandas as pd
import datetime
# 读取表A和表B的数据
df_a = pd.read_csv('table_a.csv')
df_b = pd.read_csv('table_b.csv')
# 将表A按照病人ID进行分组,将每个分组内的数据按照时间排序
df_a['time'] = pd.to_datetime(df_a['time'])
df_a_grouped = df_a.sort_values(by=['time']).groupby(['patient_id'])
# 遍历表B的数据
for index, row in df_b.iterrows():
# 在表A中找到其病人ID对应的分组,并进行二分查找,找到表A中最靠近当前行数据时间的体征
df_a_current = df_a_grouped.get_group(row['patient_id'])
df_a_closest = df_a_current.iloc[(df_a_current['time']-datetime.datetime.strptime(row['diagnosis_time'], '%Y-%m-%d %H:%M:%S')).abs().argsort()[0]]
# 将表B中的数据和找到的表A中的体征进行结合
df_b.loc[index, 'closest_feature_value'] = df_a_closest['feature_value']
# 输出处理后的表B
print(df_b)
为了让chatgpt更好地理解问题,可以在提问时使用更加具体的术语和描述,比如:
我有两张表格A和B,它们分别包含病人体征和诊断记录。我需要找到表A中与表B中每个诊断时间最接近的体征,并将它们结合到一起。同时,它们都有一个共同的病人ID列。请问,在Python中该如何实现这个功能?是否有一些优化的解决方案呢?非常感谢!