WGCNA疑问及结果解读

WGCNA分析时只选择自己感兴趣的组别（对照和实验组），剔除其他组，这样会影响结果吗？分析获得以下结果时，正常吗？

正常，但是需要在输入的矩阵也把其他组的样本剔除