数据中有≥ 以及 ≤ ,但是用r语言做出来的森林图中错误的显示成了=。
library(grid)
library(forestploter)
#读取数据
dt<-read.csv("D:/code/DFS/new dfs.csv",sep=',',header=TRUE)
#选取所需要的列数
dt <- dt[,1:17]
#检查数值型
dt$est <- as.numeric(dt$est, na.rm = TRUE)
#生成一个变量se,它在绘图的时候表示正方形的大小
dt$se <- (log(dt$hi) - log(dt$est))/1.96
#生成一个绘图区间,等下用来绘图
dt$` ` <- paste(rep(" ", 20), collapse = " ")
#生成HR和可信区间
dt$`HR (95% CI)` <- ifelse(is.na(dt$se), "",
sprintf("%.2f (%.2f to %.2f)",
dt$est, dt$low, dt$hi))#sprintF返回字符和可变量组合
# 数据框中的所有NA值替换为空字符串。
dt[is.na(dt)] <- ""
#第一行的Random effects model 移到最后一行
dt_tmp <- rbind(dt[-1, ], dt[1, ])
dt_tmp[nrow(dt_tmp), 2] <- "Random effects model"
# 设置绘图设备为PDF
pdf("D:/code/DFS/DFS.pdf", width = 15, height = 15) # 指定文件名和尺寸
#对森林图图片的细节进行调整
tm <- forest_theme(base_size = 10, #文本的大小
# Confidence interval point shape, line type/color/width
ci_pch = 20, #可信区间点的形状
ci_col = "blue", #CI的颜色
ci_fill = "red", #ci颜色填充
ci_alpha = 0.8, #ci透明度
ci_lty = 1, #CI的线型
ci_lwd = 3, #CI的线宽
ci_Theight = 0.4, # Set an T end at the end of CI ci的高度,默认是NULL
# Reference line width/type/color 参考线默认的参数,中间的竖的虚线
refline_lwd = 1, #中间的竖的虚线
refline_lty = "dashed",
refline_col = "grey20",
# Vertical line width/type/color 垂直线宽/类型/颜色 可以添加一条额外的垂直线,如果没有就不显示
vertline_lwd = 0.5, #可以添加一条额外的垂直线,如果没有就不显示
vertline_lty = "dashed",
vertline_col = "grey20",
# Change summary color for filling and borders 更改填充和边框的摘要颜色
summary_fill = "yellow",
summary_col = "#4575b4",
# Footnote font size/face/color 脚注字体大小/字体/颜色
footnote_cex = 1,
footnote_fontface = "italic",
footnote_col = "red")
#再绘图
pt <- forest(dt_tmp[, c(2, 4, 9, 10, 12, 13, 19, 20, 17)],
est = dt_tmp$est,
lower = dt_tmp$low,
upper = dt_tmp$hi,
sizes = dt_tmp$se,
is_summary = c(rep(FALSE, nrow(dt_tmp) - 1), TRUE),
ci_column = 7,
ref_line = 1,
arrow_lab = c("Young", "Non-young"),
xlim = c(0.1, 5),
ticks_at = c(0.5, 1, 2, 3),
footnote = "Heterogeneity: I^2 = 87%, τ^2 = 0.1504, p < 0.01.",
theme = tm)
plot(pt)
# 关闭PDF绘图设备并保存文件
dev.off()
因为在R语言中使用等于符号=来分配值或定义变量,为了避免歧义,大于或等于的符号使用>=来表示,小于或等于的符号用>=来表示。
引用 皆我百晓生 小程序回复内容作答:
根据你提供的代码,我注意到你使用了forestploter包来绘制森林图。在你的代码中,我没有看到任何关于≤显示为=的问题的处理。这可能是由于数据中的≤符号在绘图过程中被错误地转换为=符号。
为了解决这个问题,你可以尝试在读取数据之后,使用gsub函数将数据中的≤符号替换为<符号。例如,你可以在读取数据之后添加以下代码:
dt$`HR (95% CI)` <- gsub('≤', '<', dt$`HR (95% CI)`)
这将把数据中的≤符号替换为<符号。然后,你可以继续使用修改后的数据来绘制森林图。
希望这可以帮助到你!如果你有任何其他问题,请随时提问。
参考结合GPT4.0、文心一言,如有帮助,恭请采纳。
在R语言中,sprintf函数会将“≥”和“≤”识别为大于等于和小于等于的数学符号,而不是字符串
可以尝试使用gsub函数将“≥”和“≤”替换为相应的字符,然后再使用sprintf函数。例如:
# 生成HR和可信区间
dt$`HR (95% CI)` <- ifelse(is.na(dt$se), "",
sprintf("%.2f (%.2f to %.2f)",
dt$est, dt$low, dt$hi))
# 替换 "≥" 和 "≤"
dt$`HR (95% CI)` <- gsub("≥", ">=", dt$`HR (95% CI)`)
dt$`HR (95% CI)` <- gsub("≤", "<=", dt$`HR (95% CI)`)
【以下回答由 GPT 生成】
问题:
你好!我看到你的问题是关于使用R语言绘制森林图时出现的问题。你想要解决的问题是森林图中的"≥"显示为"=",并且你想为这个问题添加一些标签,以便ChatGPT更好地理解你的问题。
以下是你的问题及相关代码:
问题标题: r语言做出来的森林图中≤只显示= 问题标签: 开发语言 问题内容: 数据中有≥ 以及 ≤ ,但是用R语言做出来的森林图中错误的显示成了=。
library(grid)
library(forestploter)
#读取数据
dt<-read.csv("D:/code/DFS/new dfs.csv",sep=',',header=TRUE)
#选取所需要的列数
dt <- dt[,1:17]
#检查数值型
dt$est <- as.numeric(dt$est, na.rm = TRUE)
#生成一个变量se,它在绘图的时候表示正方形的大小
dt$se <- (log(dt$hi) - log(dt$est))/1.96
#生成一个绘图区间,等下用来绘图
dt$` ` <- paste(rep(" ", 20), collapse = " ")
#生成HR和可信区间
dt$`HR (95% CI)` <- ifelse(is.na(dt$se), "",
sprintf("%.2f (%.2f to %.2f)",
dt$est, dt$low, dt$hi))
#数据框中所有NA值替换为空字符串
dt[is.na(dt)] <- ""
#第一行的Random effects model 移到最后一行
dt_tmp <- rbind(dt[-1, ], dt[1, ])
dt_tmp[nrow(dt_tmp), 2] <- "Random effects model"
#设置绘图设备为PDF
pdf("D:/code/DFS/DFS.pdf", width = 15, height = 15)
#对森林图图片的细节进行调整
tm <- forest_theme(base_size = 10,
ci_pch = 20,
ci_col = "blue",
ci_fill = "red",
ci_alpha = 0.8,
ci_lty = 1,
ci_lwd = 3,
ci_Theight = 0.4,
refline_lwd = 1,
为了更好地理解你的问题,请提供一些额外的信息:
提供这些信息将有助于更好地帮助你解决问题。
【相关推荐】
尝试去除paste(rep(" ", 20), collapse = " ")这一行代码,看看运行结果有没有变化
援引讯飞星火:
这个问题可能是由于你使用的字体不支持显示≤符号。你可以尝试更换一个支持这些符号的字体,或者在生成森林图之前,将这些符号替换为其他字符。例如,你可以将"≤"替换为"<=",将"≥"替换为">="。
# 使用Unicode符号来代替特殊符号
dt$`HR (95% CI)` <- ifelse(is.na(dt$se), "",
sprintf("%.2f (\u2264 %.2f \u2264 %.2f)",
dt$est, dt$low, dt$hi)) # \u2264 是Unicode代码表示“≤”
# 使用LaTeX代码来代替特殊符号(需要加载latex2exp包)
# install.packages("latex2exp") # 如果没有安装,可以先安装
library(latex2exp)
dt$`HR (95% CI)` <- ifelse(is.na(dt$se), "",
sprintf("%.2f (%s %.2f %s)",
dt$est, LaTeX("$\\leq$"), dt$low, LaTeX("$\\leq$"), dt$hi))
# 然后进行绘图操作...
用 >=
结合GPT给出回答如下请题主参考
您好,关于您提到的森林图中错误的显示成了"="的问题,可能是因为在制作森林图时未正确设置 "<=" 和 ">=" 的符号。以下是使用 forestplot 包制作森林图的示例代码,建议您参考一下:
# 导入必要的包
library(forestplot)
# 构建数据框,示例数据
study<-c("Study1","Study2","Study3","Study4","Study5")
estimate<-c(-0.3,0.2,0.4,0.6,0.8)
lower<-c(-0.6,0.05,0.2,0.5,0.7)
upper<-c(0.3,0.35,0.6,0.7,0.9)
p.value<-c(0.03,0.12,0.05,0.002,0.001)
df<-data.frame(study,estimate,lower,upper,p.value)
# 将 "<=" 和 ">=" 符号替换为 Unicode 编码
df$lower[df$lower<0]<-paste0("≤",abs(round(df$lower[df$lower<0],2))*100))
df$lower[df$lower>=0]<-round(df$lower[df$lower>=0],2)
df$upper[df$upper>0]<-paste0(">",round(df$upper[df$upper>0],2)*100)
df$upper[df$upper<=0]<-round(df$upper[df$upper<=0],2)
# 构建森林图
forestplot(labeltext=df$study,
mean=df$estimate,
lower=df$lower,
upper=df$upper,
pval=df$p.value,
clip=c(-2,2),
xlog=TRUE,
col=fpColors(box="royalblue",line="darkblue", summary="royalblue"),
title="Example Forest Plot",
txt_gp = fpTxtGp(label=gpar(cex=0.8),
ticks=gpar(cex=0.8),
xlab=gpar(cex=0.8),
title=gpar(cex=1.2,fontface="bold")))
以上代码中,我们将 "<=" 和 ">=" 符号替换为 Unicode 编码 "≤" 和 ">",以正确显示符号。您也可以使用其他方式替换符号,只要能正确显示即可。
另外,如果您的数据中有误,例如 "<=" 符号被误识别为 "=" 符号,您可能需要对数据进行清理和修改,确保数据符合要求。
在R语言中,如果你想在森林图中只显示等于符号(=),而不显示大于或小于符号(>或<),你可以通过调整图形参数来实现。可以调整 xintercept 和 yintercept 参数的值,使得只有等于符号的位置有线条。
调整一下显示参数值
检查一下参数设置
确保你正在使用的forestploter包是最新版本,以避免已知的问题