以R中自带的ChicagoNMMAPS数据集为例(该数据集包含1987-2000年芝加哥每日的死亡率、天气(温度、露点温度、相对湿度)和污染(PM10和臭氧)等情况),如何以此数据集建立广义相加模型GAMs?其中温度为自变量,死亡率为因变量,其他因素设为混杂因素进行控制。请详细解答
在R中,可以使用mgcv包(Mixed GAM Computation Vehicle)来建立广义相加模型(GAMs)。以下是使用mgcv包建立GAMs的详细步骤:
安装和加载mgcv包:
install.packages("mgcv") # 如果还未安装mgcv包,先执行该行代码进行安装
library(mgcv)
加载ChicagoNMMAPS数据集:
data(ChicagoNMMAPS)
创建GAMs模型:
# 假设温度为自变量,死亡率为因变量,其他因素为混杂因素
gam_model <- gam(death ~ s(temp), data = ChicagoNMMAPS, family = poisson())
在上述代码中,s(temp)表示对温度进行平滑,使用自然样条函数来拟合温度和死亡率之间的非线性关系。family = poisson()表示使用泊松回归模型,适用于计数型响应变量。
查看模型结果:
summary(gam_model)
summary()函数可以用来查看GAMs模型的摘要统计信息,包括模型系数的估计值、标准误差、显著性等。
绘制模型拟合效果:
plot(gam_model)
plot()函数可以用来绘制GAMs模型的拟合效果图,展示自变量和因变量之间的关系。
通过以上步骤,你可以使用mgcv包建立广义相加模型(GAMs),并探索温度和死亡率之间的关系。你还可以根据需要调整模型中的自变量、平滑函数类型、链接函数等参数,以满足具体的分析需求。
可以参考下
https://blog.csdn.net/zhongkeyuanchongqing/article/details/120919957
可以使用R语言中的mgcv包来建立GAM模型:
ibrary(mgcv)
# 加载数据集
data <- read.csv("data.csv")
# 建立GAM模型
model <- gam(death_rate ~ s(temperature, bs = "cr"), data = data, family = gaussian())
在建立DLNM(Distributed Lag Nonlinear Models)模型时,如果显示基础基矩阵不一致,但您已经检查过并确认它们是一致的,可能有以下几个可能的原因和解决方法:
如果您仍然无法解决问题,建议您尝试以下方法:
最后,根据您的问题描述,我无法提供具体的解决方案,因为缺乏相关细节和代码示例。建议您仔细检查数据和代码,并参考相关资源和专家的建议,以解决基础基矩阵不一致的问题。
在R语言中,可以使用mgcv包来拟合GAMs模型
基于new bing的编写:
这个错误通常意味着您提供给 crosspred() 函数的数据不与您用于建立模型的基础矩阵匹配。这可能由于以下几种情况导致:
您提供的数据和您用于建立模型的数据不同(可能是维度、格式或内容上的区别)。
建模时使用的数据预处理步骤(如平滑、插值或截断)与应用 crosspred() 函数时的数据预处理步骤不同。
为了解决这个问题,您可以考虑以下步骤:
确保您提供给 crosspred() 函数的数据与您用于建立模型的数据相同。您可以检查数据的维度、列名、缺失值等方面。
确保在建模时用到的数据预处理步骤与在应用 crosspred() 函数时的数据预处理步骤相同。
检查 crosspred() 函数的输入参数是否正确设置。
如果您仍然无法解决问题,请考虑使用调试工具来诊断问题所在。可能有助于打印和比较数据、模型参数和函数参数,以及对代码进行逐行分析。另外,还可以尝试重新运行代码,或者使用其他软件包或方法进行模型拟合和预测。