求帮我看看NCBI的GSE173477的探针GPL26012如何下载

GPL26012没有table我应该如何下载全部数据进行分析？

NCBI数据下载的几种方法

可以借鉴下
https://blog.csdn.net/ma1239631998/article/details/122392654

以下回答参考GPT，并由JoseKe整理完成，希望您能采纳：
您好，要下载GSE173477的GPL26012探针芯片数据，您需要进行以下步骤：

1.访问NCBI GEO数据库网站，搜索GSE173477。

2.选择“Series Matrix File(s)”下载，将所有数据下载到本地（点击右侧“Download”按钮）。

3.在下载的文件中查找GPL26012探针芯片对应的表达矩阵文件（例如GSM5317539_ERCC_mix1_SFU_emx_1_clean_v2.counts.matrix.gz）。

4.将表达矩阵文件解压缩，即可得到GPL26012探针芯片的原始数据。

以下是下载代码示例（需要安装SRA toolkit工具）：

#安装SRA toolkit工具
wget https://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/2.11.0/sratoolkit.2.11.0-ubuntu64.tar.gz
tar -zxvf sratoolkit.2.11.0-ubuntu64.tar.gz
cd sratoolkit.2.11.0-ubuntu64/bin

#下载GSE173477的全部数据
./prefetch --max-size 100G --option-file <(esearch -db sra -query 'GSE173477' | efetch --format runinfo | cut -d ',' -f 1 | grep SRR | awk '{print " --id "$1}') 

#将SRA文件转换为fastq格式
for i in $(ls ~/ncbi/public/sra/*.sra); do ./fastq-dump $i; done

#查找GPL26012对应的表达矩阵文件名
grep "GPL26012" ~/ncbi/public/sra/GSM531753*.txt

#下载GPL26012探针芯片的原始数据
wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/samples/GSM5317xx/GSM5317539/suppl/GSM5317539_ERCC_mix1_SFU_emx_1_clean_v2.counts.matrix.gz