请问出现这种情况如何解决呢,还有就是安装的Fastqc用不了是什么原因呢
详细描述下问题?一般linux都是安装好bash的!
你怎么安装的,rh系用yum,ubuntu/debain用apt-get
sudo apt install bash
不知道你这个问题是否已经解决, 如果还没有解决的话:mkdir FastQC.dir
;进入这个目录:cd FastQC
nohup wget -c
http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0.11.5.zip 1>fastqc.o 2>fastqc.e`unzip fastqc_v0.11.5.zip
ll FastQC
chmod 777 ~/FastQC.dir/FastQC
ll fastqc
(含有x表示可以执行)echo 'export PATH=~/FastQC.dir/FastQC' >>~/.bashrc
source ~/.bashrc
.
回答:
Bash是Linux下常用的一种命令行解释器,安装Bash命令的方法如下:
1.打开终端/控制台,输入以下命令安装Bash:
sudo apt-get install bash
2.等待安装完成后,可以输入以下命令进行检查:
bash --version
若返回Bash版本信息,则表示安装成功。
设置Bash命令的方法如下:
1.打开命令行窗口,输入以下命令:
sudo update-alternatives --config bash
2.根据提示选择Bash的默认版本,确认选择即可。
至于无法使用Fastqc的原因,可能是安装不完全或者配置不正确。下面提供一种解决方法:
1.首先检查Fastqc是否已经安装,在终端中输入以下命令:
fastqc -v
若返回Fastqc版本号,则表明Fastqc已经成功安装。
2.如果Fastqc已安装,则确认Fastqc所在的路径是否已加入到环境变量中,可使用以下命令查找:
echo $PATH
3.如果Fastqc所在路径没有加入到环境变量中,则需要手动添加。在终端输入以下命令,将Fastqc所在路径添加到环境变量中:
export PATH=$PATH:/path/to/Fastqc
其中,/path/to/Fastqc需要替换为Fastqc文件夹所在的路径。
4.重新启动终端,输入以下命令,查看Fastqc是否可以正常使用:
fastqc
若可以正常使用,则表示Fastqc已经成功配置。
注:路径和Fastqc版本号可能因用户环境不同而有所不同,请根据具体的情况进行调整。