autodock vina

单个金属离子做配体，怎么用autodock vina与受体进行对接。

• 这篇文章：Autodock Vina多对多分子对接并筛选结果绘制热图 也许能够解决你的问题，你可以看下
• 除此之外, 这篇博客: Autodock Vina多对多分子对接并筛选结果绘制热图中的 一、新建一个文件夹 部分也许能够解决你的问题, 你可以仔细阅读以下内容或跳转源博客中阅读:
  

• 新建一个文件夹，将我们整理好的配体和受体文件分别放在receptor和ligand两个文件夹内。将vina相关程序也放进来。
  受体对接口袋的信息包括了xyz坐标等，要自己找到并写入到一个txt文件中，对接口袋信息举例如下

  center_x = 187.9
  center_y = -10.8
  center_z = 61.7
   
  size_x = 24.4
  size_y = 23.6 
  size_z = 37.3
  
  num_modes = 9
  

  需要注意的是将受体的对接口袋信息也放入receptor文件中，并与pdbqt文件的文件名一致。