输入fastq-dump --gzip --split-3 -A SRR3589957.sra后出现下面错误
2023-01-15T13:22:22 fastq-dump.2.11.3 err: libs/vfs/manager.c:2277:VFSManagerOpenDirectoryReadKfs: directory not found while opening manager within virtual file system module - failed to open 'SRR3589957.sra
求解决方法,感谢'
这个错误可能是因为文件路径不存在或文件名错误导致的。请确保文件路径是正确的,并确保文件名没有拼写错误。
另外,你可能需要安装 SRA 工具套件,使用 fastq-dump 工具来转换 SRA 文件到 fastq 格式。
可以使用以下命令安装SRA工具套件:
sudo apt-get install sra-toolkit
安装完成后,再次运行 fastq-dump --gzip --split-3 -A SRR3589957.sra 命令,就可以成功转换SRA文件到fastq格式了。