本人不会代码,只会用spm12和marsbar的操作界面。现在想要提取一些ROI(例如:脑岛)中全部的坐标,可以通过什么方法操作?或者说,如果marsbar做出来的ROI中包括了这些体素坐标,我应该在哪里可以找到,或者转换出来?
需要具体的操作方法,每个步骤都有的那种,求指教!
在 MarsBar 中提取 ROI 的体素坐标的具体步骤如下:
1、在 MarsBar 中打开需要提取体素坐标的 ROI。可以使用 MarsBar 的“文件”菜单下的“打开”命令来打开 ROI。
2、在 MarsBar 的“视图”菜单下选择“体素视图”。这将显示 ROI 中所有体素的位置。
3、在 MarsBar 的“文件”菜单下选择“保存”,然后选择“文本文件”作为保存格式。
4、在保存对话框中选择要保存的文件位置,并为文件命名。在文件类型选项中,选择“所有文件”,然后在文件名末尾添加“.txt”后缀。
5、点击“保存”按钮,MarsBar 将会将 ROI 中的体素坐标保存到指定的文本文件中。
注意保存的体素坐标是以三维坐标的形式保存的,每一行代表一个体素,每一列分别表示 x、y 和 z 坐标。
另外如果想要在 SPM 中查看 ROI 中的体素坐标,可以使用 SPM 的“绘图”工具。在 SPM 的“绘图”菜单下选择“体素”,然后在对话框中选择需要查看的 ROI,即可在图中看到 ROI 中的体素坐标。
望采纳。
如果你想要在 SPM12 或 MarsBaR 中提取 ROI 的体素坐标,你可以使用下列步骤:
在 SPM12 或 MarsBaR 中打开 ROI 文件。
在 SPM12 中,可以通过点击“显示”菜单中的“坐标”命令来查看 ROI 中的体素坐标。你可以在“坐标”窗口中查看每个体素的 X、Y、Z 坐标值。
在 MarsBaR 中,你可以点击“分析”菜单中的“分析”命令,然后选择“输出体素坐标”选项。这会打开一个输出坐标的对话框,你可以在其中输入文件名和保存路径,然后点击“保存”按钮将体素坐标保存到文件中。
注意:体素坐标是以 MNI 坐标系(即全身标准坐标系)为基准的,单位为毫米。
希望这些信息能帮到你!
在 SPM12 和 MarsBar 中,您可以使用以下步骤来提取 ROI 中的坐标:
打开 SPM12,然后在 SPM12 的主窗口中点击“MarsBar”按钮,打开 MarsBar 窗口。
在 MarsBar 窗口中,点击“ROI”标签,然后点击“Import ROIs from image”按钮。
在打开的文件选择窗口中,选择包含 ROI 的图像文件(通常是 NIFTI 格式的文件),然后点击“打开”按钮。
在 MarsBar 窗口中,点击“ROI”标签,然后点击“List ROIs”按钮。
在打开的“ROI List”窗口中,选择要提取坐标的 ROI,然后点击“Details”按钮。
在打开的“ROI Details”窗口中,点击“Voxels”标签,就可以看到 ROI 中所有坐标的列表了。
如果要将这些坐标转换为其他格式(例如,将它们导出为 CSV 文件),可以使用 SPM12 内置的“Export”功能进行转换。