ggplot标签位置及分组颜色配置
p1 <- ggplot(data = t_sh,
aes(x = factor(group, levels=c("0~0.3","0.3~0.5","0.5~0.7", "0.7~1.0")), y = ave_hei,fill = group))+
stat_boxplot(geom = "errorbar",width=0.3,show.legend = FALSE) +
geom_boxplot(notch = FALSE, varwidth = TRUE,
outlier.colour = "red",# 异常值颜色
outlier.shape = 2,
width=0.6)+
geom_hline(yintercept = mean(t_sh$ave_hei), linetype=2)+
geom_jitter(width = 0.25)+
stat_compare_means(method = "kruskal.test",label.y.npc = 0.8)+ # Add global annova p-value
stat_compare_means(label = "p.signif", method = "wilcox.test", ref.group = ".all.",)+
xlab("郁闭度")+
theme_zg1()+
scale_fill_manual(values = c("white","white","white","white"))+
scale_color_npg+
theme(legend.position = 'none'
)
p1
有两个问题：
1.我想让显著性检验”K-W，p=0.78“这行语句左边贴近左框线，该怎样处理？
2.我想用ggsci中npg配色，将图按照目标图形式进行配色，但我”scale_color_npg"这个语句没有发挥我预想中的效果，即颜色没有改变，请问该怎样处理
目标图：
题主您好，看了问题，回答如下：
在ggplot用一组数据做多个图时，容易出现指定不明的情况，可以在语句中写一个"color = group"来确定颜色分组，具体代码如下：
p1 <- ggplot(data = t_sh,
aes(x = factor(group, levels=c("0~0.3","0.3~0.5","0.5~0.7", "0.7~1.0")), y = ave_hei,fill = group, color = group))+
scale_fill_npg()+
结合GPT给出回答如下请题主参考
根据提供的代码，假设t_sh是一个数据框，其中有一个名为group的列，其取值为00.3、0.30.5和0.5~0.7。下面是对提供的两个问题的回答：
- ggplot标签位置：可以使用ggplot2包中的labs()函数来添加标签，并使用hjust和vjust参数来调整标签的位置，如下所示：
p1 + labs(x = "Group", y = "Value",
title = "Title", subtitle = "Subtitle",
caption = "Caption") +
theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5),
plot.subtitle = element_text(hjust = 0.5),
plot.caption = element_text(hjust = 0.5))
其中hjust和vjust参数均为0~1之间的数值，表示水平和垂直调整的比例。上面的代码将x轴标签、y轴标签、标题、副标题和注释居中显示。
- 分组颜色配置：可以使用scale_fill_manual()函数或scale_color_manual()函数来手动指定每个分组的颜色，如下所示：
p1 + scale_fill_manual(values = c("red", "blue", "green"))
或
p1 + scale_color_manual(values = c("red", "blue", "green"))
其中values参数指定了每个分组的颜色，可以使用常见的颜色名称（如red、blue、green等）或十六进制颜色码来指定。上面的代码将00.3分组的颜色设置为红色，0.30.5分组的颜色设置为蓝色，0.5~0.7分组的颜色设置为绿色。
p1 + labs(x = "Group", y = "Value",
title = "Title", subtitle = "Subtitle",
caption = "Caption") +
theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5),
plot.subtitle = element_text(hjust = 0.5),
plot.caption = element_text(hjust = 0.5))
可以看一下这个配置
p1 + labs(x = "Group", y = "Value",
title = "Title", subtitle = "Subtitle",
caption = "Caption") +
theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5),
plot.subtitle = element_text(hjust = 0.5),
plot.caption = element_text(hjust = 0.5))
然后
p1 + scale_color_manual(values = c("red", "blue", "green"))
问题1：调整显著性检验标签的位置
你可以使用geom_text()函数来自定义显著性检验标签的位置。具体来说，你可以使用label.y.npc参数来调整标签的垂直位置，使用label.x.npc参数来调整标签的水平位置。以下是如何将显著性检验标签贴近左框线的示例：
p1 +
stat_compare_means(
method = "kruskal.test",
label.y.npc = 0.8,
label.x.npc = 0.1, # 调整水平位置
label = "K-W, p=0.78"
)
问题2：使用ggsci中npg配色
要使用ggsci中的npg配色，你需要确保已经安装了ggsci库并加载了它。然后，你可以使用scale_color_npg()来应用npg配色方案。在你的代码中，你使用了scale_color_npg，但是可能有一些问题。
你可以使用以下命令安装它接下来，你可以使用scale_color_npg()来应用npg配色。如果没有效果，可能是因为scale_color_npg需要应用于geom或aes中的某个图形元素，以指定颜色映射。你可以尝试将scale_color_npg()应用于适当的图形元素或aes中的颜色。
例如，如果你希望将npg配色应用于fill参数中的颜色，你可以尝试以下方法：
p1 +
geom_boxplot(aes(fill = group), # 指定填充颜色映射
notch = FALSE,
varwidth = TRUE,
outlier.colour = "red",
outlier.shape = 2,
width = 0.6) +
scale_fill_npg() # 使用ggsci的npg配色
你的版本文档，版本文档里面有设置颜色的细节。