GEO数据读取,在创建Seurat对象时报错

在读取数据的时候报错,说输入的基因表达计数矩阵缺少细胞名称

# 创建Seurat对象
seurat_obj <- CreateSeuratObject(counts = seurat_data,
                                 project = "C_AO_",
                                 min.features = 200,
                                 min.cells = 3)

Error in CreateAssayObject(counts = counts, min.cells = min.cells, min.features = min.features,  : 
  No cell names (colnames) names present in the input matrix

引用 皆我百晓生 小程序回复内容作答:

报错信息指出输入的基因表达计数矩阵缺少细胞名称。在创建Seurat对象时,需要确保基因表达计数矩阵具有正确的维度和细胞名称。请确保seurat_data是一个正确的数据矩阵,并包含正确的细胞名称作为列名。您可以通过检查seurat_data的维度和列名来确认是否存在问题。

如果问题仍然存在,请提供更多的代码和数据信息,以便我们能够更好地帮助您解决问题。