CPAT软件出现的报错

我在使用CPAT预测转录本的蛋白编码能力时出现了报错

上网搜索是因为R语言中目标文件没有放在工作目录下导致的，但是我使用的python的脚本啊，非常疑惑，希望有使用过这个软件的能够解答一下我的疑问，非常感谢

引用 皆我百晓生 小程序回复内容作答：

CPAT软件是用R语言编写的，所以如果您在使用CPAT软件时遇到报错，即使您使用的是Python脚本，仍然可能与R语言环境有关。

报错中提到的目标文件没有放在工作目录下可能意味着CPAT软件无法找到所需的文件。请确保您已经将目标文件正确放置在工作目录下，并且将路径正确传递给CPAT软件。

同时，请确保您已经安装了CPAT软件所需要的所有依赖库和软件包。您可以在CPAT软件的官方文档或Github页面上找到详细的安装指南和使用说明。

如果问题仍然存在，请尝试联系CPAT软件的开发者或者在相关的论坛或社区寻求帮助，他们可能更熟悉软件的特点和操作问题，并能提供更具体的解决方案。