materials studio 动力学模拟后可以得到分子的速度与距离的曲线吗

在软件自带的analysis里没有找到 想着是否有脚本可以做到

您好,Materials Studio可以通过使用Forcite模块进行动力学模拟,并提取模拟过程中的分子运动信息。
直接获取速度与距离曲线的方法:

1. 在Forcite的Simulation Analysis窗口,选择Trajectory选项卡。
2. 在左侧菜单栏中选择一个或多个分子,然后在右侧勾选Displacement和Velocity。这样就可以直接得到所选分子在模拟过程中速度和位移随时间变化的曲线。
   通过编程提取信息的方法:
3. 使用Forcite的scripting功能,可以通过Python脚本提取模拟结果。
4. 获取时间步信息:
   python
   steps = framework.getSteps()
5. 获取分子在每个时间步的速度:
   python
   velocity = atom.velocity(step)
6. 获取分子在每个时间步的坐标:
   python
   position = atom.position(step)
7. 将信息整理成速度-时间曲线和位移-时间曲线。
   所以通过编程可以非常方便地从模拟结果中提取所需的速度和位移曲线。希望这些信息可以帮助您进行动力学模拟结果的后处理分析。