如何使用munge_sumstats转换 GWAS 摘要统计信息？(标签-linux)

使用munge_sumstats转换 GWAS 摘要统计信息，但失败了。有谁知道如何解决这个问题？
./munge_sumstats.py --sumstats summary.txt --snp SNP,0 --N-col N --a1 Allele1 --a2 Allele2 --frq freq --p pvalue --signed-sumstats beta,0 --out ldsc

munge_sumstats.py是来自LDSC（Linkage Disequilibrium Score Regression）软件包的工具，用于转换和准备GWAS（基因组关联研究）的摘要统计信息。如果您在使用munge_sumstats.py时遇到问题，以下是一些常见的解决方法：

检查输入文件格式和列名：确保summary.txt文件是以正确的格式提供的，并且列名与--snp、--N-col、--a1、--a2、--frq、--p、--signed-sumstats参数所指定的列名相匹配。请仔细检查列名拼写、大小写和格式是否正确。

检查依赖项和环境设置：确保您已正确安装LDSC软件包，并且您的Python环境中具有所需的依赖项。您可以检查LDSC文档或GitHub存储库了解正确的安装和环境设置步骤。

更新到最新版本：确保您使用的是最新版本的LDSC和munge_sumstats.py工具。通过查看LDSC的GitHub存储库或官方网站，您可以获取最新版本的软件和更新的文档。

查看错误消息：如果munge_sumstats.py失败，它通常会提供有关错误的提示消息。仔细阅读错误消息，以了解导致失败的原因。根据错误消息，您可以采取适当的措施来解决问题。

寻求帮助：如果以上步骤无法解决问题，您可以寻求LDSC用户社区或论坛的帮助。LDSC用户社区通常具有专家和其他用户，他们可以提供更具体的解决方案或建议。