在做正选择分析时,用code ML软件用了分支模型做这选择分析,但是看其他文献,有的用了分支模型和位点模型进行分析,还有的则做了分支模型位点模型和分支位点模型进行分析,所以现在有一些困难,不知道这几个模型有什么根本上的区别?并且我做基因家族的正选择分析的话,应该选择哪一个呢?
基因分析好像一般要用位点分析。分支是基于条件的筛选,由于信息模糊和信息不完全(这与生物信息本身特征和信息采集样本有关),条件筛选会导致错漏概率比较高。位点是基于统计的筛选方案,应用于基因分析会更适合一些。