Gretna fMRI数据预处理倒入被试文件出错

第一次接触这个领域,帮帮我这个问题怎么解决。我在用GRETNA对rs-fMRI图像进行预处理,我的DICOM文件后缀是.IMA。

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不知道你这个问题是否已经解决, 如果还没有解决的话:
  • 以下回答来自chatgpt:

    首先,需要将.IMA文件转换为NIfTI格式。可以使用dcm2niix工具来实现这个过程。具体步骤如下:

    1. 下载安装dcm2niix工具。可以从 https://github.com/rordenlab/dcm2niix/releases 下载对应系统的安装包。

    2. 打开终端(Windows用户可以使用PowerShell)。

    3. 进入.IMA文件所在的目录。

    4. 输入以下命令进行转换:

    dcm2niix -f %f -o ./ -s y -z n -x y -b n ./

    这条命令中的参数解释:

    • -f %f 指定输出文件命名格式,这里使用原始文件名(不包含后缀)作为NIfTI文件名。
    • -o ./ 指定输出目录为当前目录。
    • -s y 指定是否将多个序列压缩成一个文件。
    • -z n 指定是否压缩输出文件。
    • -x y 指定是否将bvec/bval文件与NIfTI一起输出。
    • -b n 指定是否输出b0图像。

    • 等待转换完成。转换后会在当前目录下生成与.IMA文件对应的NIfTI文件。

    • 在代码中导入NIfTI文件即可。

    如果您的代码无法导入NIfTI文件,可以考虑使用其他软件(如SPM)进行预处理。同时,建议学习一些基础知识(如MRI图像格式)以便更好地理解预处理过程。


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