MS2020的forcite模块分析高分子聚合物导电性时,进行回转半径分析得到的是回转半径的概率密度,如何得到回转半径呢?
要得到回转半径,可以计算回转半径的平均值,即对概率密度函数进行积分。具体来说,可以使用下面的公式计算回转半径Rg:
Rg = (3/5 * integral(R^2 * P(R) dR))^(1/2)
其中,R表示回转半径,P(R)表示回转半径的概率密度函数,integral是积分符号。
Materials studio forcite模块模拟聚合物不同配比的相容性
https://zhuanlan.zhihu.com/p/556256076
你目前得到只是回转半径的概率密度函数还不是回转半径。根据概率密度函数,可以计算出回转半径在不同角度下的分布概率。这个分布概率通常是以角度为横坐标,以分布概率为纵坐标的形式给出。然后,根据分布概率和角度的关系,可以计算出回转半径在不同角度下的期望值。这个期望值通常是以角度为横坐标,以期望值为纵坐标的形式给出。最后,可以根据期望值和角度的关系,得到回转半径在不同角度下的具体值
参考
在Materials Studio的Forcite模块中,打开聚合物模拟项目。
确保已经完成了分子动力学模拟或蒙特卡洛模拟,并且成功生成了模拟结果。
在Forcite模块的工具栏中,选择"Analysis"(分析)选项。
在分析选项中,选择"Rg"(回转半径)或"Radius of Gyration"(回转半径)。
在"Rg"选项中,选择计算回转半径的方法,比如使用原子质量或元素质量加权计算。
选择所需的计算方法后,点击"Calculate"(计算)按钮 。
可以使用Forcite模块中的随机游走模拟、分子动力学模拟等方法,通过与散射函数的拟合来确定聚合物的回转半径
forcite模块是一个软件,它可以帮助科学家研究高分子聚合物的性质。其中回转半径是用来描述聚合物链条长度的一个参数。在使用forcite模块分析过程中,可以通过回转半径的概率密度函数来得到聚合物链的回转半径。这个过程涉及到一些复杂的数学方法,包括基于自由能和径向分布函数等。
要得到回转半径就再处理一下,先在 forcite 模块中的输出文件中找到存储回转半径概率密度函数的数据文件(.dat),然后导入到 Materials Script ,
再对数据文件中的概率密度函数进行积分操作得到累积分布函数,就得到了回转半径的中位数,最后通过回转半径的公式计算出来,公式是回转半径Rg = sqrt(1/N * sum(r^2) - (1/N * sum(r))^2)
计算一下就行,
如有帮助还麻烦帮忙点个赞
答案参考ChatGPT Plus版,整理汇总。希望能帮助你解决问题
在MS2020中的forcite模块分析高分子聚合物导电性时,回转半径是通过概率密度分布计算得到的。回转半径是描述高分子链的空间尺寸和柔软度的指标,它表示高分子链的平均空间展开程度。
通过forcite模块进行回转半径分析时,该模块会对高分子链进行模拟,模拟过程中会对高分子链的构象进行采样。在采样的过程中,模拟程序会记录高分子链不同构象下的回转半径,并将这些回转半径值进行统计。
具体来说,forcite模块使用分子动力学模拟方法,模拟高分子链在一定温度下的运动。通过对高分子链的构象进行采样,可以得到不同构象下的高分子链的几何形状。然后,通过对这些几何形状进行分析和处理,可以计算出回转半径的概率密度分布。
回转半径的计算通常是基于高分子链的原子坐标。在分子动力学模拟中,高分子链的原子坐标会在一定时间间隔内被记录下来。通过对这些原子坐标进行分析,可以得到高分子链不同构象下的回转半径。
总之,通过forcite模块进行回转半径分析时,它会通过分子动力学模拟和几何形状的采样,计算出高分子链的回转半径概率密度分布,从而提供了关于高分子链展开程度的信息。这样的分析结果可以帮助理解高分子聚合物导电性的形成机制和性能表现。