有人来指教一下吗 经常看见集成学习用shap来解释 不怎么看见神经网络用它解释 或者有什么方法能增强神经网络的可解释行吗 能出可视化图的最好
注意画图前需要加:
shap.initjs()
不加就会报错:
Visualization omitted, Javascript library not loaded!
Have you run `initjs()` in this notebook? If this notebook was from another user you must also trust this notebook (File -> Trust notebook). If you are viewing this notebook on github the Javascript has been stripped for security. If you are using JupyterLab this error is because a JupyterLab extension has not yet been written.
如果想要在论文中添加SHAP模型输出的图,只是在代码最后加上plt.savefig,保存下来的图像为空白图。python的shap库,底层仍然使用matplotlib,根据源码可以发现在调用shap.xxx_plot时可以选择传递一个参数就可以正常使用plt.savefig了,几种不同的shap.xxx_plot需要传递的参数可能是不一样的,下面就举几个例子,一般情况下加上matplotlib=True,show = False这两个参数的比较多
除了下面几个例子,瀑布图直接调用plt.savefig即可,shap.decision_plot则需要传入参数return_objects=True
shap.force_plot(explainer.expected_value, shap_values[j], data[cols].iloc[j],matplotlib=True,show = False)
plt.savefig('./result_300dpi.jpg', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.jpg', bbox_inches='tight', dpi=150)
plt.savefig('./result_300dpi.png', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.png', bbox_inches='tight', dpi=150)
plt.savefig('./result_300dpi.tiff', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.tiff', bbox_inches='tight', dpi=150)
plt.savefig('./result_300dpi.svg', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.svg', bbox_inches='tight', dpi=150)
shap.summary_plot(shap_values, data[cols],show = False)
plt.savefig('./result_300dpi.jpg', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.jpg', bbox_inches='tight', dpi=150)
plt.savefig('./result_300dpi.png', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.png', bbox_inches='tight', dpi=150)
plt.savefig('./result_300dpi.tiff', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.tiff', bbox_inches='tight', dpi=150)
plt.savefig('./result_300dpi.svg', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.svg', bbox_inches='tight', dpi=150)
shap.dependence_plot('age', shap_values, data[cols], interaction_index=None, show=False)
plt.savefig('./result_300dpi.jpg', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.jpg', bbox_inches='tight', dpi=150)
plt.savefig('./result_300dpi.png', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.png', bbox_inches='tight', dpi=150)
plt.savefig('./result_300dpi.tiff', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.tiff', bbox_inches='tight', dpi=150)
plt.savefig('./result_300dpi.svg', bbox_inches='tight', dpi=300)
plt.savefig('./result_150dpi.svg', bbox_inches='tight', dpi=150)
回答:
Shap是一个用于解释和分析机器学习模型的Python库,其最初的目的是对支持向量机进行可解释性的分析和解释。后来,它被扩展到解释各种类型的机器学习模型,包括神经网络回归模型。使用Shap解释神经网络回归模型的方法大致如下:
1.导入必要的库和数据集:
import numpy as np
import pandas as pd
import tensorflow as tf
import shap
# Load data
train_data = pd.read_csv('train.csv')
test_data = pd.read_csv('test.csv')
# Preprocess data
X_train = train_data.drop(['target'], axis=1).values
y_train = train_data['target'].values
X_test = test_data.drop(['target'], axis=1).values
y_test = test_data['target'].values
2.建立模型并进行训练:
def create_model():
model = tf.keras.Sequential([
tf.keras.layers.Dense(500, activation='relu', input_shape=(X_train.shape[1],)),
tf.keras.layers.Dense(100, activation='relu'),
tf.keras.layers.Dense(1)
])
model.compile(optimizer='adam', loss='mse')
return model
model = create_model()
model.fit(X_train, y_train, epochs=10, batch_size=32, validation_data=(X_test, y_test))
3.使用Shap进行特征重要性分析:
# Create an explainer
explainer = shap.KernelExplainer(model.predict, X_train)
# Calculate Shapley values
shap_values = explainer.shap_values(X_test)
# Summarize the results
shap.summary_plot(shap_values, X_test, plot_type='bar')
以上代码会生成特征重要性的直方图和散点图,可以用于解释哪些特征在模型中是最重要的。
除此之外,Shap还提供了一些其他的可视化工具,例如 force plot,dependence plot和decision plot。这些工具可以帮助我们更好地理解如何使用模型解释数据并获得哪些洞察。
总的来说,使用Shap解释神经网络回归模型的方法并不困难,只需要导入必要的库、建立模型并训练、使用Shap计算特征重要性等步骤即可。另外,Shap还提供了一些可视化工具,可以帮助我们更好地理解模型的解释和洞察。
神经网络模型本质上是一种黑盒模型,其内部运作过程通常难以直接解释。
但是实操过程中是可以使用一些技术来增强神经网络的可解释性
可视化神经网络结构:可以通过工具如TensorBoard对神经网络的结构、输入输出、层之间连接等进行可视化,从而更好地理解神经网络在学习和推理时的行为。
激活热力图(Activation heatmap): 可以通过可视化神经网络中每个特征层中神经元的激活强度,观察神经网络是如何响应不同种类样本的刺激的。这种方法尤其适用于图像分类等领域。
局部可解释性 (Local interpretability):可以使用一些技术,如LIME或SHAP,在给定单个输入和输出时,将神经网络的预测与输入特征之间建立起简单易懂的关联,以解释神经网络的预测结果。
全局可解释性 (Global interpretability):可以使用其他机器学习算法或者手动特征工程等方法,将数据转换成容易理解的特征表达形式,从而使神经网络的学习过程和预测结果更加易于理解和解释。