windows系统下转录组数据上游分析,能不能具体一点,Windows系统处理数据太麻烦了
在Windows系统下进行转录组数据的上游分析,可以使用许多生物信息学工具来实现。下面是一些可能有用的工具和步骤:质量控制:首先,您需要对原始的转录组测序数据进行质量控制。您可以使用FastQC工具来检查数据的质量,并使用Trimmomatic工具来去除低质量的序列和接头。序列比对:接下来,您需要将清理后的序列比对到参考基因组上。您可以使用Bowtie2、STAR、HISAT2等工具来实现。这些工具的具体使用方法和参数设置可以参考它们的官方文档或相关的论文。转录本组装:如果您的研究需要对转录组进行组装和注释,您可以使用Trinity、Cufflinks、StringTie等工具来实现。这些工具可以将比对后的序列组装成转录本,并对其进行注释和定量。差异表达分析:最后,您可以使用DESeq2、edgeR、limma等工具来进行差异表达分析,找出在不同样品之间表达量差异显著的基因或转录本。需要注意的是,在进行转录组数据分析之前,您需要了解基本的生物信息学知识和实验设计,并准备好一些必要的软件和数据资源。此外,在Windows系统下处理数据的确有一些麻烦,但也有很多优秀的生物信息学软件可以在Windows上运行,并且有很多社区和论坛可以提供帮助和支持。
目的:在windows下监控某一个进程5天的内存使用,查看是否有内存泄露
实现:考虑过各种工具,最后选择批处理实现
代码:
代码实现监控redis进程,每隔1分钟将tasklist查到的内存使用情况存入redis.txt文件中
@echo off
rem 这段用来将脚本放入后台运行
if "%1"=="hide" goto CmdBegin
start mshta vbscript:createobject("wscript.shell").run("""%~0"" hide",0)(window.close)&&exit
:CmdBegin
rem 这段用来从tasklist中查找到redis-server.exe这行,然后提取第5列,分隔符是空格,最后将日期和时间及查到的内存数输出到redis.txt文件中
:top
for /f "tokens=5 delims= " %%a in ('tasklist /nh ^|findstr /i redis-server.exe') do echo %date% %time% %%a >> redis.txt
rem 使用ping来实现每隔60s
ping -n 60 127.0.0.1>nul
goto top
得到的数据
2019/05/23 周四 11:27:44.44 381,064
2019/05/23 周四 11:28:43.98 401,224
2019/05/23 周四 11:29:43.53 413,752
2019/05/23 周四 11:30:43.06 378,804
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