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在cmder中下载sra数据后要把sra数据转化成fastq时出现呢以下界面
在cmder中下载sra数据后要把sra数据转化成fastq时出现呢以下界面
求解决方法,感谢
这是因为您没有正确下载sra数据,请重新下载sra数据,然后再尝试转换成fastq格式。
首先,在NCBI SRA数据库中搜索您需要的sra数据;
然后,使用wget命令下载sra数据,例如:wget
ftp://ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR358/SRR3589958/SRR3589958.sra
最后,使用fastq-dump命令将sra数据转换成fastq格式,例如:fastq-dump --split-files SRR3589958.sra
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