不读取的情况下打乱列表

我需要彻底打乱一个列表，这个列表在磁盘里，是文件格式。有这么大

所以我不能把它整个读取。
里面大概长这样，

注意只打乱大列表的顺序。
例如

打乱前：[[1,1],[2,2],[3,3],[4,4]]
打乱后：[[1,1], [4,4], [3,3], [2,2]]

我这个示例列表是用random.shuffle()打乱的，但是我没法直接吧这么大的列表读到内存里。
必须完全打乱，否则会影响后期加密的安全性。

只能通过java程序， 转json，之后不按顺序读取，之后插入