R语言一个函数及内部参数的作用
clust = cutreeStatic(sampleTree, cutHeight = 70, minSize = 10)
用代码块功能插入代码,请勿粘贴截图
我想要达到的结果:获悉这个函数删除的究竟是什么 ,是对切割高度上的数据进行,还是切割高度下的,以及minSize是剩下的模块的最小数量吗?
这些东西我看R上都没有仔细说明,查了很多也没有查出来
这个是目的是数据清洗,剔除离群样本。如你这个参数所示,cutHeight即切割高度,剔除70以上的样本;minSize是保证每个树枝的最少样本量,你这里是10。一般做WGCNA都是定义高度,较少会用到minSize(因为一般都是符合要求的),不过具体情况具体分析