使用monocle进行拟时序分析时，在细胞排序orderCells时报错怎么办

问题：
在用R语言中的monocle进行拟时序分析时，在画拟时许图的前一步细胞排序时报错，怎么办？
问题相关代码：
**sc_cds2 <- orderCells(sc_cds2)**
运行结果及报错内容
Error in if (class(projection) != "matrix") projection <- as.matrix(projection) :
the condition has length > 1
In addition: Warning message:
In graph.dfs(dp_mst, root = root_cell, neimode = "all", unreachable = FALSE, :
Argument neimode' is deprecated; use mode' instead

前边的步骤也报错过，就是建立monocle的对象newCellDataSet，也报错过，后来问了别人是因为matrix构建的不对，代码如下
sc_cds_2 <- newCellDataSet(matrix, phenoData = pd,featureData =fd,expressionFamily = negbinomial.size(),lowerDetectionLimit=0.01)

把matrix<-as.sparse(mmt@assays$RNA@counts)
改成matrix<-as.sparse(mmt@assays$RNA@counts)
后就好了。据说因为R版本的问题，函数的功能有些变动。

I attach a modified version of Monocle (2.26.0) according to the discussion. One can install it locally. I hope this one helps somebody.

https://github.com/cole-trapnell-lab/monocle-release/files/10134172/monocle_2.26.0.tar.gz

请问改成什么样子呢？遇到同样的问题

解决了吗，具体怎么解决的，我已经被这个困扰半月了

请问解决了吗，我也遇到了这个问题

您好，我也遇到一摸一样的问题，请问你这个重新设置矩阵的位置和后面改的matrix是怎样的，因为你提供的更改matrix似乎是一样的，如果方便，能不能贴出时序分析整段代码，如有看到，谢谢不吝赐教！

同问

重装2.18.0或2.21.1版本