在Ubuntu上使用RTCGAToolbox下载数据时遇到了Error in download.file(url=filelink,destfile=tcgafile,method=“auto”)

在Ubuntu上使用Rstudio下载TCGA数据库时遇到了Error in download.file(url=filelink,destfile=tcgafile,method=“auto”)问题。
代码:
library("RTCGAToolbox")
length.MArrayLM <- function(x) prod(dim(x))
getFirehoseDatasets()
Data = getFirehoseData(dataset = "BRCA",runDate = "20140115",
clinical = TRUE,RNASeqGene = TRUE,mRNAArray = TRUE,
Mutation = TRUE)
前面的代码都没问题,可以正常执行
重要的是这段代码:
Data = getFirehoseData(dataset = "BRCA",runDate = "20140115",
clinical = TRUE,RNASeqGene = TRUE,mRNAArray = TRUE,
Mutation = TRUE)
从控制台内容来看,好像是download.file函数无法加载网址
该怎么解决呢?
使用的代码和控制台信息如图。

img

连接网页下载超时,导致下载数据不完整。
一是设置一下超时选项:
比如:options(timeout=120),或更长时间。
二是可以试试这里的下载数据集方法:
https://blog.csdn.net/weixin_39770226/article/details/109907291