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如何把SDF/JSON格式的分子图转化为graphormer的输入?
在现在很火的图神经网络Graphormer中,它的源码为 code:
https://github.com/microsoft/Graphormer
它的输入都是dgl或者pyg中的数据集,但如果我自己下载的药物分子的图表示是SDF格式或JSON格式。我需要对它们进行什么样的预处理,才能把它们作为graphormer的输入呢?
需要预处理文件
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