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非模式物种的氨基酸序列要做go和kegg分析

我想一个药用植物的go和kegg富集分析。
目前已经得到了它的转录组的氨基酸序列。
请问下一步应该怎么做啊?
我看的大佬的帖子里面大多使用Trinity。但是很多都是用的Linux,Linux之前没接触过。
可以用那些windos能使用的工具来得到它的unigene啊?

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