在处理突变数据的时候,得到多个突变类型矩阵,行为基因,列为样本,每个矩阵代表一种突变类型。
如何不添加新的行、新的列,合并这些矩阵的信息到一个矩阵中?(有些基因可能有两种突变类型,同一个样本的同一个基因有两种或两种以上突变的话就用"Muti_Hit"代替)
#加载包
library(IMvigor210CoreBiologies)
#突变数据准备
data(fmone)
summary(fmone)
likely_short <- (fmone@assayData)$likely_short
known_short <- (fmone@assayData)$known_short
amplifications <- (fmone@assayData)$amplification
deletions <- (fmone@assayData)$deletion
gains <- (fmone@assayData)$gain
上面的likely_short、known_short 、amplifications等就是不同的突变类型文件,我的目的是先合并它们,然后做突变全景图
类似于下面这张图这样的结果,一个表里包含多种突变类型,然后同一个样本的同一个基因有两种或两种以上突变的话就用"Muti_Hit"代替。希望能有人教教俺,向您表示最诚挚的谢意!
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