生物学细胞形状特征提取

分析4.png

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,提取所有的细胞形状特征,openCV或者python的其他图像分析包都可以,convolution啥的,我的目的如图片process所示

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虽然上传的图片是png格式,但是我自己的图片都是tif格式,16bit, 4096强度。需要原代码,急需,没办法,只能这样了。

使用matlab来解决这个很方便, 里面已经集成了二值化, 分割, 统计等相关工具, 下面是我做的一个尝试, 不知道是否满足楼主需求:

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这个是简单的统计结果:

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基于python的图片处理包还是很多的,比如PIL,Pillow, opencv, scikit-image等,scikit-image是基于scipy的一款图像处理包,它功能非常齐全,同时将图片作为numpy数组进行处理,几乎集合了matlab的所有图像处理功能,在数据的处理方式,函数名字等方面对matlab的模仿姿势非常到位。想了解更多,请关注我