好问题。我觉得可能是和噪声的性质有相关性的原因。
噪声多数属于高频的，当然也有低频的噪声，但是对于某一段时间而言，可能这种噪声出现是有规律可循的，当信号分解为频域或者时域信息的时候，就能够将噪声信号显著的分离出来或者使用某种滤波手段将其过滤出来。
原始数字信号直接进行处理分析，就失去了时域频域分析的可能性。