变分自编码（VAE）的隐藏空间维度是如何确定的？

比如我有一个高维数据（几万行四十多列），如何应用到VAE中进行训练，隐藏空间的维度如何选取？应该怎么选？

这个属于超参数，需要你自己去调参。一般来说可以用pca等方法分析参数的相关性。