两种颜色的热图怎么画

我现在计算出来了不同死亡率下的细胞总数 我想画出一个横纵坐标分别是g细胞和s细胞的死亡率 细胞数为零或者负值的显示为黑色 有数值的显示出来红色 应该怎么画呢 所以细胞总数的存储方式又是什么

引用 皆我百晓生 小程序回复内容作答:
要画出两种颜色的热图,表示细胞数,你可以使用Python中的matplotlib库来实现。以下是一个基本的示例代码:

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np

# 细胞数的数据,这里假设是一个2D的数组
cell_counts = np.array([[0, -3, 5], [4, 8, 0]])

# 定义颜色映射,黑色表示0或负值,红色表示有数值
cmap = plt.cm.colors.ListedColormap(['black', 'red'])
bounds = [np.min(cell_counts), 0, np.max(cell_counts)]
norm = plt.cm.colors.BoundaryNorm(bounds, cmap.N)

# 绘制热图
plt.imshow(cell_counts, cmap=cmap, norm=norm)

# 设置坐标轴标签
plt.xlabel('G cells death rate')
plt.ylabel('S cells death rate')

# 显示颜色条
plt.colorbar()

# 显示图像
plt.show()

在这个示例中,cell_counts是一个2D的数组,表示不同死亡率下的细胞总数。细胞数为0或负值的位置显示为黑色,有数值的位置显示为红色。

细胞总数的存储方式可以是一个二维数组,其中每个元素表示相应位置的细胞总数。在上述代码中,cell_counts是一个示例细胞数的二维数组。

你可以根据实际情况修改代码,调整颜色映射、细胞数数据以及坐标轴标签等,以满足你的需求。

【以下回答由 GPT 生成】

答案:

为了实现这个热图,我们可以使用Python中的matplotlib库。下面是具体的解决方案:

  1. 导入所需的库:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
  1. 定义细胞总数的数组变量,并根据实际情况进行赋值。假设总共有n个不同死亡率下的细胞总数,可以使用一个n x n的二维数组来存储细胞总数。其中,行表示s细胞死亡率,列表示g细胞死亡率。如果细胞总数为0或负值,将其设置为np.nan(缺失值)。
cell_counts = np.array([[0, 10, 20], [30, -40, 50], [60, 70, 80]])
cell_counts[cell_counts <= 0] = np.nan
  1. 创建一个热图对象,并设置显示的颜色方案。红色可以使用Reds,黑色可以使用Greys(使用灰度颜色)。
cmap = plt.cm.Reds  # 红色显示有数值
cmap.set_bad(color='black')  # 黑色显示无数值
  1. 绘制热图。使用imshow函数来绘制热图,并设置相关参数。
plt.imshow(cell_counts, cmap=cmap, origin='lower')
  1. 添加颜色条。使用colorbar函数来添加颜色条,方便观察热图中各颜色对应的数值。
plt.colorbar()
  1. 设置坐标轴标签。使用xlabel和ylabel函数来设置横坐标和纵坐标的标签。
plt.xlabel("g细胞的死亡率")
plt.ylabel("s细胞的死亡率")
  1. 显示热图。使用show函数来显示生成的热图。
plt.show()

完整的代码如下所示:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

cell_counts = np.array([[0, 10, 20], [30, -40, 50], [60, 70, 80]])
cell_counts[cell_counts <= 0] = np.nan

cmap = plt.cm.Reds
cmap.set_bad(color='black')

plt.imshow(cell_counts, cmap=cmap, origin='lower')
plt.colorbar()
plt.xlabel("g细胞的死亡率")
plt.ylabel("s细胞的死亡率")
plt.show()

希望这个解决方案对您有帮助!如果您有任何问题,请随时向我提问。



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