求问孟德尔随机化使用TwoSampleMR包,将A作为暴露因素时出现以下报错,但将A作为结局因素时不影响代码运行,是什么原因呢?
Error in check_required_columns(exposure_dat, "exposure") :
The following required columns are missing from exposure: SNP, id.exposure, exposure, beta.exposure, se.exposure, effect_allele.exposure, other_allele.exposure
本来以为是数据不能获取,所以有上述列的缺失,但作为结局因素可以运行的话数据应该是可以获取的,想不通
引用 皆我百晓生 小程序回复内容作答:
这个错误信息表明在使用TwoSampleMR包进行孟德尔随机化时,暴露因素的数据表中缺少必要的列,包括SNP、id.exposure、exposure、beta.exposure、se.exposure、effect_allele.exposure和other_allele.exposure。这意味着你的数据中缺少这些必要的列,导致无法正确运行代码。
然而,当你将A作为结局因素时,代码能够运行,可能是因为此时使用的数据表中包含了所需的列。因此,推测可能是在不同的数据表中,A作为暴露因素的数据表中缺少了一些必要的列。
你可以仔细检查A作为暴露因素的数据表,确保其中包含了上述报错中提到的所有列。如果确保数据表中包含了这些列之后,仍然出现此错误,可能需要进一步检查数据表的格式或其他数据相关问题。