R语言批量作图时纵坐标异常无数据


for (i in 1:10){name <- colnames(t_sh)[i]
p <- ggplot(data = t_sh, 
             aes(x = factor(group, levels=c("0~0.3","0.3~0.5","0.5~0.7", "0.7~1.0")), y = colnames(t_sh)[i], fill = group))+
  stat_boxplot(geom = "errorbar",width=0.3,show.legend = FALSE) +
  geom_boxplot(notch = FALSE, varwidth = TRUE,
               outlier.colour = "red",# 异常值颜色
               outlier.shape = 2,
               width=0.8)+
  geom_hline(yintercept = mean(t_sh$ave_hei), linetype=2)+
  geom_jitter(width = 0.25)+
  stat_compare_means(method = "kruskal.test")+ # Add global annova p-value
  stat_compare_means(label = "p.signif", method = "wilcox.test", ref.group = ".all.",vjust = 3)+
  xlab("郁闭度")+
  ylab("")+
  theme_zg1()+
  scale_fill_manual(values = c("purple","blue","green","turquoise"))+
  theme(legend.position = 'none')+
  theme(axis.title = element_text(family = "TNM", face = "bold", size = 18,colour = "black"))+
  theme(axis.text = element_text(family = "TNM", face = "bold", size = 16,color="black"))
  ggsave(p,file= paste(name,'.png',sep = ''),
         width = 10,height = 5)
  }

这里我有一个数据t_sh，我这里想遍历这个数据的除最后一列的每一列，并做出箱式图

但是出现问题，我所做出的图的纵坐标为文字，没有数据，是怎么回事呢？该怎么处理，谢谢大家

该回答通过自己思路及引用到GPTᴼᴾᴱᴺᴬᴵ搜索,得到内容具体如下：
根据您提供的代码和图片，问题可能出现在这一行代码上：

y = colnames(t_sh)[i]

colnames(t_sh)[i]返回的是列名而不是数据本身，因此纵坐标显示的是文字而不是数据。您需要修改代码以使用实际的数据列。

假设您的数据列存储在t_sh数据框中，您可以使用以下代码来获取实际的数据列：

y = t_sh[, i]

这将从t_sh数据框中选择第i列的数据作为纵坐标。

修改后的代码如下：

for (i in 1:10) {
  name <- colnames(t_sh)[i]
  p <- ggplot(data = t_sh, 
              aes(x = factor(group, levels = c("0~0.3", "0.3~0.5", "0.5~0.7", "0.7~1.0")), y = t_sh[, i], fill = group)) +
    stat_boxplot(geom = "errorbar", width = 0.3, show.legend = FALSE) +
    geom_boxplot(notch = FALSE, varwidth = TRUE,
                 outlier.colour = "red",  # 异常值颜色
                 outlier.shape = 2,
                 width = 0.8) +
    geom_hline(yintercept = mean(t_sh$ave_hei), linetype = 2) +
    geom_jitter(width = 0.25) +
    stat_compare_means(method = "kruskal.test") +  # Add global annova p-value
    stat_compare_means(label = "p.signif", method = "wilcox.test", ref.group = ".all.", vjust = 3) +
    xlab("郁闭度") +
    ylab("") +
    theme_zg1() +
    scale_fill_manual(values = c("purple", "blue", "green", "turquoise")) +
    theme(legend.position = 'none') +
    theme(axis.title = element_text(family = "TNM", face = "bold", size = 18, colour = "black")) +
    theme(axis.text = element_text(family = "TNM", face = "bold", size = 16, color = "black"))
  
  ggsave(p, file = paste(name, '.png', sep = ''), width = 10, height = 5)
}

请确保您的数据列包含数值类型的数据，否则可能会导致其他错误。如果问题仍然存在，请提供更多的信息，以便我可以更好地帮助您解决问题。

如果以上回答对您有所帮助，点击一下采纳该答案～谢谢

你的问题是关于R语言的批量作图，特别是在使用ggplot2包进行箱线图绘制时遇到的纵坐标异常无数据的问题。

从你的代码来看，你在使用for循环对列名为"t_sh"的数据框进行作图。你在每次循环中都选择了不同的y轴变量（即colnames(t_sh)[i]），这可能是问题的根源。如果某些列没有数据或者数据为NA，那么这些列就不会出现在图上。

我建议你检查你的数据框"t_sh"，确保所有的列都有有效的数值。你可以使用以下代码来检查每列是否包含NA值：

for (i in 1:ncol(t_sh)){
  print(sum(is.na(t_sh[,i])))
}

此外，你也需要确保你选择的列名实际上是存在于你的数据框中的。你可以使用以下代码来检查：

for (i in 1:10){
  name <- colnames(t_sh)[i]
  if(!name %in% colnames(t_sh)){
    print(paste("The column", name, "does not exist in your data frame."))
    next
  }
  # Continue with your plotting code
}

最后，我建议你检查"group"变量是否存在，以及它是否是因子类型。如果不是，你可能需要在你的ggplot代码中将它转换为因子类型。你可以使用以下代码来检查：

if(!"group" %in% colnames(t_sh)){
  print("The 'group' column does not exist in your data frame.")
} else if(!is.factor(t_sh$group)){
  t_sh$group <- as.factor(t_sh$group)
}

希望这些建议能帮助你解决问题。如果你还有其他问题，欢迎继续提问。

如果在R语言中进行批量作图时出现纵坐标异常或无数据的情况，可能有几个原因导致。以下是一些常见的问题和解决方案：

数据范围问题：确保你的数据范围适合所选的图形类型。例如，如果你正在使用折线图（line plot），但数据的范围非常大，可能会出现纵坐标异常的情况。你可以尝试调整数据范围或使用其他适合数据的图形类型。
缺失值处理：检查数据中是否存在缺失值（NA）。如果有缺失值，它们可能导致图形出现问题。你可以使用na.omit()函数或其他方法来处理缺失值。
图形参数设置：检查你的图形参数设置，特别是与纵坐标相关的参数。例如，ylim参数可用于设置纵坐标的范围。确保这些参数设置正确，以适应你的数据。
数据转换：如果你的数据需要进行某些转换（例如，对数转换），确保在绘图之前进行转换。这可以通过使用log()函数或其他适当的函数来完成。
异常值处理：数据中可能存在一些异常值，导致图形出现问题。你可以使用箱线图或其他方法来识别和处理这些异常值。
图形类型选择：确保你选择的图形类型适合你的数据和分析目标。不同的图形类型可能对数据的展示有不同的要求。

如果以上方法仍然无法解决问题，你可以提供更多关于你的数据和代码的信息，以便更好地理解和解决问题。

【以下回答由 GPT 生成】

问题的原因可能是设置纵坐标为t_sh的列名时，纵坐标的数据类型不正确，导致无法正确显示数据。可以通过以下两种方式解决这个问题：

方法一：检查纵坐标的数据类型和格式是否正确

首先，检查纵坐标列的数据类型，确保它们是数值型数据。可以使用class()函数检查数据类型，例如：class(t_sh[, i])。如果数据类型不是数值型，需要进行数据类型的转换。
如果数据类型不正确，可以使用as.numeric()函数将列的数据类型转换为数值型数据。例如：t_sh[, i] <- as.numeric(t_sh[, i])。
接着，检查纵坐标列的数据格式，确保它们没有被错误地识别成字符型数据。可以使用str()函数查看数据的结构，例如：str(t_sh)。

方法二：使用tidyverse包进行数据处理和绘图

首先，安装并加载tidyverse包，它是一个功能强大的数据处理和绘图包。可以使用以下代码安装并加载它：

install.packages("tidyverse")
library(tidyverse)

然后，使用gather()函数将数据集从宽格式转换为长格式，方便后续处理。具体代码如下：

t_sh_long <- t_sh %>%
  gather(column, value, -group)

接着，使用ggplot()函数和geom_boxplot()函数绘制箱线图。在aes()函数中，将纵坐标设置为value列，横坐标设置为group列。具体代码如下：

p <- ggplot(data = t_sh_long, 
            aes(x = factor(group, levels = c("0~0.3", "0.3~0.5", "0.5~0.7", "0.7~1.0")), 
                y = value, 
                fill = group)) +
  stat_boxplot(geom = "errorbar", width = 0.3, show.legend = FALSE) +
  geom_boxplot(notch = FALSE, varwidth = TRUE,
               outlier.colour = "red",  # 异常值颜色
               outlier.shape = 2,
               width = 0.8) +
  geom_hline(yintercept = mean(t_sh$ave_hei), linetype = 2) +
  geom_jitter(width = 0.25) +
  stat_compare_means(method = "kruskal.test") +  # 添加整体Anova p-value
  stat_compare_means(label = "p.signif", method = "wilcox.test", ref.group = ".all.", vjust = 3) +
  xlab("郁闭度") +
  ylab("") +
  theme_zg1() +
  scale_fill_manual(values = c("purple", "blue", "green", "turquoise")) +
  theme(legend.position = 'none') +
  theme(axis.title = element_text(family = "TNM", face = "bold", size = 18, colour = "black")) +
  theme(axis.text = element_text(family = "TNM", face = "bold", size = 16, color="black"))

最后，使用ggsave()函数保存绘制的图像。可以使用以下代码保存图像，文件名为列名加上.png后缀：

ggsave(p, file = paste(name, '.png', sep = ''),
       width = 10, height = 5)

综上所述，您可以尝试使用上述方法来解决纵坐标只显示文字而没有数据的问题。如果问题仍然存在，请提供更多关于t_sh数据集的信息，例如数据的结构和示例数据，以便更好地分析和解决问题。

如果你已经解决了该问题, 非常希望你能够分享一下解决方案, 写成博客, 将相关链接放在评论区, 以帮助更多的人 ^-^

引用皆我百晓生小程序回复内容作答：
根据您提供的R代码，问题可能出在这一行代码上：

y = colnames(t_sh)[i]

colnames(t_sh)[i]返回的是列名（文字），而不是实际的数据。因此，在绘制图表时，纵坐标（y轴）显示的是列名而不是数据值。

您可以通过修改代码来解决这个问题。在aes()函数中，将y的取值改为t_sh[, i]，这样就可以使用实际的数据进行作图了。修改后的代码如下所示：

for (i in 1:10) {
  name <- colnames(t_sh)[i]
  p <- ggplot(data = t_sh, 
              aes(x = factor(group, levels = c("0~0.3","0.3~0.5","0.5~0.7", "0.7~1.0")), y = t_sh[, i], fill = group)) +
    stat_boxplot(geom = "errorbar", width = 0.3, show.legend = FALSE) +
    geom_boxplot(notch = FALSE, varwidth = TRUE, outlier.colour = "red", outlier.shape = 2, width = 0.8) +
    geom_hline(yintercept = mean(t_sh$ave_hei), linetype = 2) +
    geom_jitter(width = 0.25) +
    stat_compare_means(method = "kruskal.test") +
    stat_compare_means(label = "p.signif", method = "wilcox.test", ref.group = ".all.", vjust = 3) +
    xlab("郁闭度") +
    ylab("") +
    theme_zg1() +
    scale_fill_manual(values = c("purple", "blue", "green", "turquoise")) +
    theme(legend.position = 'none') +
    theme(axis.title = element_text(family = "TNM", face = "bold", size = 18, colour = "black")) +
    theme(axis.text = element_text(family = "TNM", face = "bold", size = 16, color = "black"))
  ggsave(p, file = paste(name, '.png', sep = ''), width = 10, height = 5)
}

通过这个修改，您应该可以正确地绘制出每列数据的箱式图了。请注意，这里假设t_sh是一个数据框（data frame），并且有足够的行数与需要绘制的数据列数对应。


for (i in 1:10) {
  name <- colnames(t_sh)[i]
  p <- ggplot(data = t_sh, 
              aes(x = factor(group, levels = c("0~0.3", "0.3~0.5", "0.5~0.7", "0.7~1.0")), y = t_sh[, i], fill = group)) +
    stat_boxplot(geom = "errorbar", width = 0.3, show.legend = FALSE) +
    geom_boxplot(notch = FALSE, varwidth = TRUE,
                 outlier.colour = "red",  # 异常值颜色
                 outlier.shape = 2,
                 width = 0.8) +
    geom_hline(yintercept = mean(t_sh$ave_hei), linetype = 2) +
    geom_jitter(width = 0.25) +
    stat_compare_means(method = "kruskal.test") +  # Add global annova p-value
    stat_compare_means(label = "p.signif", method = "wilcox.test", ref.group = ".all.", vjust = 3) +
    xlab("郁闭度") +
    ylab("") +
    theme_zg1() +
    scale_fill_manual(values = c("purple", "blue", "green", "turquoise")) +
    theme(legend.position = 'none') +
    theme(axis.title = element_text(family = "TNM", face = "bold", size = 18, colour = "black")) +
    theme(axis.text = element_text(family = "TNM", face = "bold", size = 16, color = "black"))
  ggsave(p, file = paste(name, '.png', sep = ''), width = 10, height = 5)
}

是前一个数据把后一个覆盖了吧

问题出现在这一行代码中：

aes(x = factor(group, levels=c("0~0.3","0.3~0.5","0.5~0.7", "0.7~1.0")), y = colnames(t_sh)[i], fill = group))+

你把 y 映射到了 colnames(t_sh)[i]，这会导致纵坐标显示列名而不是数据。如果你想要绘制箱线图，你应该将 y 映射到数据列，而不是列名。
要解决这个问题，你可以修改上述代码为：

aes(x = factor(group, levels=c("0~0.3","0.3~0.5","0.5~0.7", "0.7~1.0")), y = t_sh[, i], fill = group))+

这样，y 将映射到 t_sh 数据框中的相应列，而不是列名。这应该可以解决你的问题，使图形显示正确的数据。

R语言10-绘图异常值处理(限制轴)

异常数值出现有很多原因，有的异常值是极端案例的准确数据，有的则为坏数据

异常数值的出现常会造成长尾数据

为避免长尾数据，我们通常对坐标轴进行限制：

方法：使用xlim，进行限制
library(ggplot2)
qplot(x=friend_count,data = pf,xlim = c(0,1000))

结合GPT给出回答如下请题主参考
根据您提供的信息，无法判断出出现问题的具体位置，建议提供更多的信息和代码。

以下是一些可能会导致纵坐标异常无数据的原因：

数据中存在缺失值或者数据格式错误，可以使用summary()函数或者str()函数查看数据情况；
可能因为几何图层中参数设置不当，例如因为数据中没有符合条件的标签而未显示刻度标签；
可能因为y轴的范围设置不当导致数据不显示，可以使用scale_y_continuous()函数调整范围。

示例代码：

library(ggplot2)

# 随机生成数据
set.seed(123)
t_sh <- data.frame(fact = rep(c("A", "B"), each = 20),
                   x = rnorm(40, 0, 1),
                   y = rnorm(40, 0, 1))

# 批量作图
for (i in 1:2) {
  name <- colnames(t_sh)[i+1]
  p <- ggplot(data = t_sh, aes(x = fact, y = t_sh[[i+1]])) +
    geom_boxplot() +
    labs(title = name)
  print(p)
}

以上代码会生成两个箱线图，分别以变量x和y为纵坐标。如果数据中存在缺失值或格式错误，可能会导致纵坐标异常无数据的情况。如果该代码运行时出现问题，可以提供更多的信息和代码，方便问题的定位和解决。