8.文件操作-统计如下路径每个子目录内in.fa文件序列数量

8.文件操作-3
统计如下路径每个子目录内in.fa文件序列数量
/mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/*/in.fa
结果参考:/mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/seq.stat.xls

【以下回答由 GPT 生成】

为了实现统计指定路径下每个子目录内的in.fa文件序列数量,可以使用以下步骤实现:

  1. 首先,使用命令find来获取指定路径下满足条件的in.fa文件的路径列表。命令如下所示:
find /mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3 -type f -name "in.fa"

此命令将会递归地搜索指定路径下所有子目录,并且仅返回名称为in.fa的文件路径列表。

  1. 将上一步得到的文件路径列表保存到一个临时文件中,以便后续处理。可以使用重定向操作符>将结果保存到一个文本文件中。命令如下所示:
find /mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3 -type f -name "in.fa" > /mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/temp.txt
  1. 使用Python编程语言读取临时文件中的路径列表,并统计每个子目录中的in.fa文件数。可以使用open函数来打开临时文件,并使用逐行读取的方法统计文件数。可以使用字典来保存每个子目录对应的文件数。具体代码如下所示:
file_counts = {}
with open("/mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/temp.txt", "r") as file:
    for line in file:
        file_path = line.strip()
        directory = file_path.rsplit("/", 2)[0]  # 提取子目录路径
        if directory in file_counts:
            file_counts[directory] += 1
        else:
            file_counts[directory] = 1
  1. 将得到的每个子目录中的in.fa文件数写入到结果文件中。可以使用open函数打开结果文件,并使用write方法将统计结果写入。具体代码如下所示:
with open("/mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/seq.stat.xls", "w") as output_file:
    output_file.write("Subdirectory\tFile_Count\n")
    for directory, count in file_counts.items():
        output_file.write(directory + "\t" + str(count) + "\n")

至此,你已经获得了每个子目录中的in.fa文件序列数量,并将结果存储在/mnt/sdb/share/bin/linux-demo/file3/seq.stat.xls文件中。如果你在某一步遇到困难,请告诉我。


如果你已经解决了该问题, 非常希望你能够分享一下解决方案, 写成博客, 将相关链接放在评论区, 以帮助更多的人 ^-^