目前有一个表型，分为了0-5级这6个级别，那我在进行GWAS的时候应该按照质量性状处理还是数量性状处理呢？在使用--logistic的时候报错，说建议使用--linear，但是表型就分为6种，应该也不能算是数量性状。这种情况该怎么办呢？
引用 皆我百晓生 小程序回复内容作答：
在进行GWAS（基因组关联研究）时，通常会根据表型的性质选择适当的统计模型。对于质量性状，可以使用逻辑回归模型（--logistic），而对于数量性状，可以使用线性回归模型（--linear）。
根据你描述的情况，表型被分为了0-5级这6个级别，这种情况下可以考虑将其视为数量性状进行处理。尽管表型的级别是离散的，但是它们之间存在一定的顺序关系，因此可以将其视为数量性状进行分析。
如果你在使用--logistic模型时遇到了报错，建议尝试使用--linear模型进行分析。在使用--linear模型时，你可以将表型的级别作为连续变量进行处理，这样可以更好地适应你的数据。
需要注意的是，GWAS的分析方法和模型选择可能因研究目的、数据特点和统计软件的不同而有所差异。建议在进行GWAS之前，仔细阅读相关文献和方法论，并咨询专业人士以获取更准确的建议。