请问：ZDOCK对接结果在pymol上打开出错，在schrodinger maestro和Chimera上无法打开，但是能够再jmol中打开是怎么回事呀

对接的一个蛋白质是alphafold预测结构，一个是冷冻电镜测得结构。我试过用maestro优化alphafold预测的结构再对接，但结果还是这样，实在不明白哪里出错了，请问有人可以帮我看看是什么情况吗～

【以下回答由 GPT 生成】

问题的描述比较复杂，我会尽力给出解决方案，但可能需要一些假设和一般性的建议。首先，我需要明确一些关键信息，包括您使用的软件版本和具体的错误信息。然后，我会尝试找出问题所在并提供可能的解决方案。

在等待您提供更多详细信息的同时，我可以给出一些一般性的建议：

确认软件版本：请提供您所用软件的具体版本信息，包括ZDOCK、PyMOL、Schrodinger Maestro、Chimera等软件版本。这有助于我们在解决问题时针对特定版本进行定位。
检查兼容性：不同软件之间的兼容性可能有所不同，尤其是针对不同数据来源的蛋白质结构。可能存在某些软件无法正确处理某种数据格式或特定的结构数据。因此，请确保您使用的软件和数据格式是兼容的。
检查输入文件：请确认您所用的输入文件是否完整、正确，并符合所用软件的要求。特别注意输入文件的格式、坐标和其他必需的信息。
尝试不同软件：如果您只能在特定软件中成功打开对接结果，请考虑在该软件中进行后续的可视化和分析工作。举例来说，如果Jmol是唯一能成功打开该结果的软件，请考虑在Jmol中进一步进行结构分析，或者尝试将结果转换为其他软件接受的格式。
建立联系：如果您仍然遇到问题，请尝试联系软件开发者或讨论社区以获取帮助。他们可能能够提供具体的解决方案或进一步的调试建议。

请记住，由于问题描述不完整，我只能就一般情况下可能出现的问题给出建议。如果您能提供更多详细信息，我将尽力提供更具体的解决方案。

如果你已经解决了该问题, 非常希望你能够分享一下解决方案, 写成博客, 将相关链接放在评论区, 以帮助更多的人 ^-^