生成的sam文件的header不能被读取，不知道哪个环节出了问题

我用seqtk包将.fasta文件转换成.fastq后，用下列语句进行比对
bowtie2 -p 16 - hap_genome -U .fq -S .sam
后形成的sam文件用samtools view转换成.bam文件
出现的问题，如图

提示header不可用，读取失败

我换了fasta_to_fastq.pl进行文件转化再进行比对，而且比对不同的基因组也是同样的结果。我的sam的头文件如图

整个比对是在linux中进行的，在miniconda的环境中，samtools还是bowtie2都是用conda安装的。是我的原始测序数据有问题吗？网上找不到解决办法，恳请大家帮我想想问题出在哪里？非常感谢！