扩增子分析用data2生成特征表和代表序列后,计算核心多样性报错。
保存内容:The rarefied table contains no samples or features.
求指点
这个错误通常是由于样本稀疏性(样本数或特征数太少)导致的。您可以尝试调整参数来解决这个问题。
针对这个问题,您可以尝试以下解决方案:
检查您的输入数据,确保其中的每个样本都包含足够的序列数据。如果某些样本具有非常少的序列数据,则可能需要将这些样本从分析中删除或重新评估其质量。
尝试调整--p-sampling-depth
参数的值来增加样本数。这个参数控制了稀疏表在进行计算时采样的深度。增加这个参数的值可以增加分析中的样本数,从而提高计算核心多样性的成功率。
尝试使用其他稀疏化方法,例如--p-min-frequency
或--p-max-depth
参数,这些参数也可以控制稀疏表的稀疏度。
确认您的输入数据是否正确,并且所有必要的列和行都存在。同时,确保您的数据文件格式与您正在使用的分析工具所期望的格式相匹配。
如果您尝试了以上方法,仍然无法解决问题,建议您尝试查看更详细的日志和错误信息以获取更多帮助。