R语言诊断性分析 异质性检验

求问r语言里诊断学meta分析,要求异质性得到p和I平方的代码怎么求呀,还有应该准备什么样的表格数据,目前提取了tp等四格表信息😭

在R语言中,可以使用metafor包来进行meta分析,并计算异质性(heterogeneity)的p值和I平方(I-squared)。具体步骤如下:

  1. 安装metafor包
install.packages("metafor")
  1. 加载metafor包
library(metafor)
  1. 准备数据

在进行meta分析之前,需要准备一个数据框,其中包含每个研究的效应量(effect size)、标准误(standard error)、样本量(sample size)和其他相关信息。例如:

dat <- data.frame(
  study = c("Study 1", "Study 2", "Study 3", "Study 4", "Study 5"),
  yi = c(0.5, 0.8, 1.2, 1.5, 2.0),
  sei = c(0.2, 0.3, 0.4, 0.5, 0.6),
  ni = c(50, 60, 70, 80, 90)
)

在上面的代码中,我们创建了一个名为dat的数据框,其中包含5个研究的效应量、标准误和样本量。

  1. 进行meta分析

使用rma函数进行meta分析,并计算异质性的p值和I平方。例如:

res <- rma(yi, sei^2, data=dat)

在上面的代码中,我们使用rma函数进行meta分析,并将结果存储在名为res的对象中。其中,yi表示效应量,sei表示标准误,data表示数据框。

  1. 计算异质性的p值和I平方

使用summary函数来查看meta分析结果,并计算异质性的p值和I平方。例如:

summary(res)

在上面的代码中,我们使用summary函数来查看meta分析结果,并计算异质性的p值和I平方。在输出结果中,可以找到异质性的p值和I平方。

请注意,上述代码中的数据框dat应该包含每个研究的效应量、标准误和样本量等信息。如果您只提取了tp等四格表信息,可能需要进行一些数据处理,以便将其转换为meta分析所需的格式。具体处理方式可能因数据而异,建议您参考metafor包的官方文档,了解数据格式的要求和处理方法。