MacRStudio加载SummarizedExperiment包报错

大家好，我刚开始学生信，最近刚开始学R。我的电脑是MacAir，intel芯片。
我想安装SummarizedExperiment的包，可以安装，但是在加载的时候报错了。我电脑只装过R4.3，但是它会查找R4.2的路径。我尝试重现安装R、RStudio，安装gfortran and XQuartz，但是都不行。
https://mac.r-project.org/tools/ 我尝试按照这个网站里说的下载，但是liblzma、PCRE2、bzip2下载之后不知道该怎么使用。
寻求大家帮忙，不胜感激。

Error: package or namespace load failed for ‘SummarizedExperiment’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.3-x86_64/Resources/library/DelayedArray/libs/DelayedArray.so':
dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.3-x86_64/Resources/library/DelayedArray/libs/DelayedArray.so, 0x0006): Library not loaded: '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.2/Resources/lib/libR.dylib'
Referenced from: '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.3-x86_64/Resources/library/DelayedArray/libs/DelayedArray.so'

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https://ask.csdn.net/questions/7936084
这个问题已解决，感谢@Py小郑之前的帮助

您好，关于您的问题，我建议您尝试以下几个步骤：

  1. 确认R的版本与系统的兼容性

首先需要确认您的R版本与系统的兼容性，如果您的R版本与系统不兼容，可能会导致安装包无法正常安装或加载出错。您可以查看R的官方网站，确认您的R版本与系统的兼容性。另外，建议升级至最新的R版本，这可能会有助于解决问题。

  1. 确认SummarizedExperiment包的依赖性

SummarizedExperiment包有很多依赖包，如果这些依赖包没有正确安装，可能会导致SummarizedExperiment包加载出错。您可以尝试使用以下命令安装SummarizedExperiment包的所有依赖包：

install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("SummarizedExperiment")
  1. 确认库路径

您可以使用以下命令查看R中默认的包安装路径：

.libPaths()

确认这个路径是否与您安装的SummarizedExperiment包的路径相同。如果路径不同，您可以使用以下命令将包的路径添加到R的搜索路径中：

.libPaths("/path/to/your/package")
  1. 确认环境变量

最后，请确认您的系统环境变量是否设置正确，特别是与gfortran和XQuartz相关的环境变量。如果这些环境变量没有正确设置，可能会导致SummarizedExperiment包加载出错。您可以使用以下命令检查gfortran是否已经正确安装：

system("gfortran --version")

如果您看到gfortran的版本信息，则说明它已经正确安装。如果您没有看到gfortran的版本信息，您可能需要重新安装gfortran。

至于liblzma、PCRE2、bzip2这些依赖包，您可以尝试使用以下命令安装：

brew install liblzma
brew install pcre2
brew install bzip2

安装完成后，这些依赖包应该已经添加到系统的库中了，您无需手动使用它们。

希望这些方法可以帮助您解决问题，祝您好运！