gromacs时,每次到运行gmx grompp -f ions.mdp -c GC_solv.gro -p topol.top -o ions.tpr -maxwarn 700,总会报错输入文件有误

无论是什么蛋白质配体文件,每次到运行这一代码总会报错。想不清这是为什么?请问该怎么解决呢?谢谢解答!

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你用的哪个版本的linux

以下内容部分参考ChatGPT模型:


首先,根据报错信息,可以看到是与输入文件有关的问题。因此,我们需要检查输入文件是否正确。

其次,根据报错信息中的“Fatal error”,可以看到这是一个致命错误,因此我们需要认真查看错误信息,找出具体出错的原因。

然后,根据报错信息中的“maxwarn 700”,可以看到是最大警告数为700,因此我们可以尝试增加最大警告数来看看是否能够解决问题。

最后,我们可以参考Gromacs官方文档或者向Gromacs官方社区寻求帮助,以解决这个问题。

下面是一些可能有用的命令和代码:

检查输入文件是否正确:

gmx check -f <input_file>

查看错误信息:

cat <error_file>

增加最大警告数:

gmx grompp -f ions.mdp -c GC_solv.gro -p topol.top -o ions.tpr -maxwarn 1000

Gromacs官方文档:https://manual.gromacs.org/documentation/current/index.html

Gromacs官方社区:https://gromacs.bioexcel.eu/