AutoDock运行报错,看不太懂,有人可以解答一下嘛?
```python
ERROR *********************************************
Traceback (most recent call last):
File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.7\lib\site-packages\ViewerFramework\VF.py", line 941, in tryto
result = command( *args, **kw )
File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.7\lib\site-packages\Pmv\fileCommands.py", line 1431, in doit
newparser = Mol2Parser(filename)
File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.7\lib\site-packages\MolKit\mol2Parser.py", line 43, in __init__
MoleculeParser.__init__(self, filename)
File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.7\lib\site-packages\MolKit\moleculeParser.py", line 36, in __init__
self.filename = str(filename)
UnicodeEncodeError: 'ascii' codec can't encode characters in position 9-10: ordinal not in range(128)
Exception in Tkinter callback
Traceback (most recent call last):
File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.7\lib\lib-tk\Tkinter.py", line 1410, in __call__
return self.func(*args)
File "C:\Program Files (x86)\MGLTools-1.5.7\lib\site-packages\Pmv\fileCommands.py", line 614, in guiCallback
mols.data.extend(mol.data)
AttributeError: 'str' object has no attribute 'data'
The file C:/Program Files (x86)/3dzh.mol2 is empty
adding gasteiger charges to pymol
```
该回答通过自己思路及引用到各个渠道搜索综合及思考,得到内容具体如下:
这个错误提示包含两个错误:
1. UnicodeEncodeError: 'ascii' codec can't encode characters in position 9-10: ordinal not in range(128)
这个错误通常是由于文件路径中包含非ASCII字符(比如中文)而导致的。
在Python 2中,默认使用ASCII编码来处理字符串,在处理非ASCII字符时会出现编码错误。
如果你的文件路径中包含了非ASCII字符,可以在文件路径前面加上一个小写的'r',表示使用原始字符串,即不对字符串进行任何编码转换。
例如pyhon代码如下:
filename = r'C:\Program Files (x86)\3dzh.mol2'
2. AttributeError: 'str' object has no attribute 'data'
这个错误通常是由于读取的文件格式不正确或文件为空导致的。在这个例子中,AutoDock读取的文件格式是mol2格式,可以检查一下文件是否符合mol2格式的要求,或者尝试使用其他格式的文件进行测试。
同时,最后一行提示文件为空,也可以检查一下文件是否存在或是否为空。
如果以上回答对您有所帮助,点击一下采纳该答案~谢谢
不知道你这个问题是否已经解决, 如果还没有解决的话: