使用超算（linux系统）跑fluent的算例，内有udf的调动，上传.cas和.dat到超算之后，不知道怎么调动udf。

使用超算（linux系统）跑fluent的算例，内有udf的调动，上传.cas和.dat到超算之后，不知道怎么调动udf。超算无法图形化可视化！只能通过命令行执行
使用的是fluent2021R1，已安装到超算上，建立了文件夹fluent run 文件夹，cas和dat还有.c文件都是放在这里面。
没有UDF的情况下直接 qsub mm.pbs 启动fluent调动jou文件开始计算。

参考GPT：在 Linux 系统上运行 Fluent 并调用 UDF，需要完成以下步骤：

1 确保 UDF 能够在本地计算机上成功编译。

2 将编译后的 UDF 文件（如 libudf.so）上传到 Linux 超算的 Fluent 运行目录下，例如上述的 "fluent run" 文件夹。

3 在 Fluent 的计算过程中加载 UDF，可以使用 Fluent 提供的命令行工具 TUI（Text User Interface）来完成。可以在 Fluent 启动时，通过命令行添加 -tui 选项，进入 TUI 界面。在 TUI 界面下，可以使用以下命令来加载 UDF：

define/user-defined function-hooks/your-hook-name your-udf-library.so

其中，"your-hook-name" 是你想要加载的 UDF 的 hook 名称，"your-udf-library.so" 是你上传的 UDF 的共享库文件名。

4 编写 Fluent 计算脚本（jou 文件），在文件中添加加载 UDF 的命令，例如：

rc fluentm.cas
define/user-defined function-hooks/your-hook-name your-udf-library.so
rd fluentm.dat
solve/initialize/hyb-initialization
solve/dual-time-iterate 1000 10 0.01

其中，"your-hook-name" 和 "your-udf-library.so" 分别替换为你上传的 UDF 的 hook 名称和共享库文件名。

5 使用 PBS（Portable Batch System）或其他作业调度系统提交计算任务。在 PBS 脚本中，可以添加以下命令来调用 Fluent 计算脚本（jou 文件）：

./fluent 3ddp -t $NPROCS -cnf $PBS_NODEFILE -i your-jou-file.jou >& log.txt &

其中，"-t $NPROCS" 指定使用的进程数，"-cnf $PBS_NODEFILE" 指定节点文件的位置，"your-jou-file.jou" 指定需要运行的 Fluent 计算脚本（jou 文件）的文件名，">& log.txt &" 则将运行过程的日志输出到 log.txt 文件中，并且将 Fluent 进程放到后台运行。
6 使用 qsub 命令提交 PBS 脚本，例如：

qsub mm.pbs

其中，"mm.pbs" 是 PBS 脚本的文件名。
7 提交 PBS 作业后，可以使用命令 qstat 来查看作业状态和进程运行情况。Fluent 进程的输出和日志可以在 log.txt 文件中查看。如果有错误或者问题，可以通过日志信息来排查问题。

要在Fluent中使用UDF，需要将编译后的动态库文件（.so文件）与Fluent进行链接，并将其指定为UDF库。在Linux上，UDF需要在Linux上进行编译，以生成可在Linux上运行的动态库文件。

以下是在超算上使用Fluent UDF的一般步骤：

确保已安装Fluent，并使用Fluent提供的makefile进行UDF编译。在超算上，需要检查您是否已安装正确的Fluent版本，并且可以通过设置适当的环境变量来启用makefile。

生成.so文件：使用Fluent提供的makefile，将UDF编译为动态库文件（.so文件）。生成的.so文件需要与Fluent进行链接。

链接.so文件：在Fluent中，使用define/user-defined-functions菜单来将.so文件链接到Fluent中。在Fluent GUI中，选择Define→User-Defined→Functions菜单，在“Library Management”对话框中添加所需的.so文件。

启用UDF：要启用UDF，需要在Fluent的GUI中指定相应的函数。例如，在定义速度输入的UDF时，您需要在Fluent中选择Define→Boundary Conditions菜单，并指定UDF名称以及需要使用UDF的相关设置。

启动Fluent：在使用UDF的Fluent案例上，可以通过在PBS脚本中使用Fluent命令行启动Fluent，或使用GUI中的Fluent Launcher来启动Fluent。

这是一个一般性的步骤，具体需要根据您的具体情况进行调整。如果您遇到了任何问题，建议您参考Fluent官方文档或咨询Fluent技术支持。

该回答引用于gpt与OKX安生共同编写：
  • 该回答引用于gpt与OKX安生共同编写：

在超算上运行Fluent时调用UDF，需要进行以下操作：

    1. 将UDF文件（.c）上传到超算的Fluent目录下。例如，如果您的Fluent软件安装在/home/fluent/fluent2021R1目录下，则可以将UDF文件上传到该目录下的src/udf目录中。
    1. 在提交PBS任务时，通过-sge-script命令指定Fluent执行脚本。例如，在mm.pbs文件中添加以下命令：

    fluent 3d -g -t${NSLOTS} -i input-file.cas -pib -sge-script=/path/to/fluent2021R1/src/udf/udf.scr

    其中，-sge-script参数指定了Fluent执行脚本的路径，这里假设udf.scr文件位于Fluent目录下的src/udf子目录中。

    1. 在Fluent界面中加载UDF。首先，在Fluent的Graphic User Interface (GUI)中打开输入文件（input-file.cas），然后选择“Define” -> “User-Defined” -> “Functions” -> “Interpreted…”，在弹出的对话框中选择您要使用的UDF文件，点击“Load”。
    1. 运行计算。在Fluent界面中选择“Solve” -> “Execute Commands”，输入需要执行的Fluent命令，然后点击“Execute”。Fluent将自动编译和加载UDF，并开始计算。

注意事项：

  • 确保上传的UDF文件与Fluent版本兼容，并且已经正确编译。
  • 如果Fluent在运行过程中遇到UDF相关的错误，可以通过检查.log文件和Fluent输出信息来定位问题所在，并及时修复。
  • 如果UDF需要读取外部数据文件，确保这些文件也已经上传到超算上，并且文件路径正确。
  • 如有用的话，还望采纳哦~
  • 非常抱歉，我的回答不够完整和详细。对于您遇到的问题，我给更具体的建议。

针对UDF文件的上传和加载，确保您已经将UDF文件上传到超算上，并且该文件与Fluent版本兼容。在提交PBS作业时，您需要通过在mm.pbs文件中添加以下命令来指定执行脚本：

fluent 3d -g -t${NSLOTS} -i input-file.cas -pib -sge-script=/path/to/fluent2021R1/src/udf/udf.scr

其中，-sge-script参数指定了Fluent执行脚本的路径，这里假设udf.scr文件位于Fluent目录下的src/udf子目录中。请确保此路径为正确的脚本路径。

关于如何在没有图形界面的情况下加载UDF，可以使用文本编辑器打开input-file.cas文件，找到“define/user-defined/functions”部分，手动添加UDF路径并加载。例如，在input-file.cas文件中添加以下内容：

(define
   (rpsetvar 'udf-library '"/path/to/fluent2021R1/src/udf/")
   (rpsetvar 'udf-name '("my_udf.so"))
   (rpsetvar 'udf-function '("my_udf")))

其中，'"/path/to/fluent2021R1/src/udf/"'是UDF所在的路径，'"my_udf.so"'是UDF的名称，'"my_udf"'是UDF中需要执行的函数名称。在此之后，可以通过Fluent界面中的“Solve” -> “Execute Commands”方式来运行计算。

如果您使用的是文本命令行界面，可以将以上代码保存为文本文件并作为参数传递给Fluent进行加载和运行，例如：

fluent 3d -g -t${NSLOTS} -i input-file.cas -pib -sge-script=/path/to/fluent2021R1/src/udf/udf.scr -i udf-params.txt

其中，'udf-params.txt'是包含以上代码的文本文件。

另外，请注意确保您的UDF与Fluent版本兼容，并已经正确编译。如果Fluent在运行过程中遇到UDF相关的错误，可以通过检查.log文件和Fluent输出信息来定位问题所在，并及时修复。

  • 回答如上，望采纳！
  • 确定UDF是否已经正确编译常见的做法是通过在Fluent命令窗口中执行以下命令进行检查：
/define/user-defined/compiled-functions
  • 如果UDF已经正确编译，您将看到类似以下内容的输出：
Compiled functions:
  my_udf     - /path/to/my_udf.so

其中，'my_udf'是UDF中需要执行的函数名称，'/path/to/my_udf.so'是UDF库文件的完整路径。

  • 如果您看到了类似于"Function not compiled"等错误信息，则说明UDF没有被正确编译。此时，您可以检查您的UDF是否具有正确的函数签名，并确认您使用的编译器版本和选项是否与Fluent版本和操作系统兼容。您还可以检查.log文件和Fluent输出信息以获取更多有用的信息。
  • 另外，请注意，/define/user-defined/compiled-functions命令只能显示已经成功编译并加载的UDF。如果您的UDF存在语法错误或逻辑错误，或者依赖其他库或头文件，它可能无法成功编译或加载。因此，您需要仔细检查您的UDF代码，并确保它符合Fluent的要求。

以下答案由GPT-3.5大模型与博主波罗歌共同编写：
首先，需要将UDF文件编译成动态链接库（.so文件）并上传到超算。在Linux系统中，使用Fluent提供的编译脚本进行编译：

fluentCompileUDF <UDF文件名>

编译完成后会生成一个动态链接库文件，可以在Fluent中通过以下命令加载：

(define <（UDF名称）> ‘(rpread “<（.so文件名）>”))

在Fluent中，可以通过journal文件（.jou）调用UDF。在启动Fluent时，通过命令行指定journal文件路径即可：

/fluent/fluent2021R1/bin/fluent 3ddp -g -i /<（jou文件路径）>/<（jou文件名）>

在PBS脚本中，可以通过以下方式指定journal文件路径：

fluent 3d -g -t <（线程数）> -mpi=intel -pib -ssh -i <（jou文件路径）>/<（jou文件名）>

注意，在运行PBS脚本时，需要使用qsub命令而不是直接运行脚本。

除此之外，还需要设置Fluent运行时的环境变量，可通过如下命令设置：

export FLUENT_HOSTNAME=<主机名>
export FLUENT_ROOT=/<Fluent安装路径>
export PATH=$PATH:$FLUENT_ROOT/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$FLUENT_ROOT/lib

以上命令可放在PBS脚本的开头，确保在运行Fluent前先设置了必要的环境变量。

综上所述，PBS脚本可以按照以下方式编写：

#!/bin/sh
#PBS -l nodes=<节点数>:ppn=<每个节点的核心数>
#PBS -N <作业名称>
#PBS -o <标准输出文件路径>
#PBS -e <标准错误输出文件路径>

# 加载Fluent运行所需的环境变量
export FLUENT_HOSTNAME=<主机名>
export FLUENT_ROOT=/<Fluent安装路径>
export PATH=$PATH:$FLUENT_ROOT/bin
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$FLUENT_ROOT/lib

# 进入Fluent工作目录
cd /<工作目录>

# 编译UDF
fluentCompileUDF <UDF文件名>

# 运行Fluent
fluent 3d -g -t <线程数> -mpi=intel -pib -ssh -i <jou文件路径>/<jou文件名>

exit 0

如果我的回答解决了您的问题，请采纳！

在Linux系统下，使用Fluent跑含有UDF的算例需要进行以下步骤：
1. 在超算上编译UDF文件
在超算上使用gcc编译UDF文件，生成.so文件。命令如下：

gcc -shared -o libudf.so udf_filename.c -I/fluent2021R1/fluent/inc -L/fluent2021R1/fluent/lib -lfluent -lm

其中，udf_filename.c是UDF文件名，/fluent2021R1/fluent是Fluent的安装路径。
2. 在Fluent中加载UDF
在Fluent中加载UDF需要在命令行中输入以下命令：

define/user-defined/compiled-functions load libudf

其中，libudf是生成的.so文件名。
3. 设置UDF参数
在Fluent中设置UDF参数需要在命令行中输入以下命令：

define/user-defined/compiled-functions/set-function function-name parameter value

其中，function-name是UDF函数名，parameter是函数参数名，value是参数值。
4. 启动计算
在Fluent中启动计算需要在命令行中输入以下命令：

solve/initialize
solve/iterate n