eggnog数据库下载
download_eggnog_data.py --data_dir ./ -y -f euk bact arch viruses
报错
usage: download_eggnog_data.py [-h] [-D] [-P] [-M] [-H] [-d HMMER_DBS] [-y]
[-f] [-s] [-q] [--data_dir]
download_eggnog_data.py: error: unrecognized arguments: euk bact arch viruses
我懂了得用代号才行比如
download_eggnog_data.py --data_dir ./ -y -f -H -d 2
# 2 代表 bacteria
参考GPT和自己的思路：看起来你的命令行参数不正确。在这个命令中，你似乎尝试使用未知的参数“euk”、“bact”、“arch”和“viruses”。
如果你希望下载所有的EggNOG数据库，请尝试运行以下命令：
download_eggnog_data.py -y -f -a
这应该会下载所有四个数据库。你还可以通过添加--data_dir参数来指定数据下载目录。例如，以下命令将数据下载到当前目录的eggnog_data子目录中：
download_eggnog_data.py -y -f -a --data_dir ./eggnog_data
希望这可以帮助到你！
基于最新版ChatGPT4和个人想法回答，望采纳！！！有其他问题也可以询问我哦💕（最新版更智能，功能更加强大）：
根据您提供的信息，似乎是在运行 download_eggnog_data.py 时输入了不正确的命令行参数。可以通过运行 download_eggnog_data.py --help 来查看正确的参数格式和说明。
您可以尝试使用以下命令行参数来下载 eggnog 数据库：
python download_eggnog_data.py --data_dir ./ --tax_scope 'eukaryota, bacteria, archaea, viruses' --overwrite --silent
其中，--tax_scope 参数指定需要下载的生物分类，多个分类之间用逗号隔开；--overwrite 参数用于覆盖已存在的文件；--silent 参数用于禁止输出下载进度和信息。
请注意，下载 eggnog 数据库可能需要较长时间和较大的存储空间，具体取决于您下载的数据集大小。