刘永鑫博士扩增子分析流程中otu_mean.R报错:error in getopt

6.3筛选各组高丰度菌,把otu_mean.R添加到设定地址后,在rstdio中输入代码报错,有人碰到过这个问题的吗,怎么解决的呢

我的代码:Rscript otu_mean.R --input otutab.txt --design metadata.txt --group Group --thre 0 --output result/otutab_mean.txt

报错:Usage: otu_mean.R [options]

otu_mean.R: error: Error in getopt(spec = spec, opt = args) : long flag "design" is
invalid

这说明 getopt这个函数调用错了,建议调试下,看看参数是不是不对。