新手小白一枚,现本科阶段跟着老师做课题,目前进度至分析Rg,老师让看Gromacs说明书,没看懂,哪位大神可以指点一下具体步骤,跪谢!
Gromacs可以使用结构分析模块来计算回旋半径。要使用此功能,首先需要将模拟系统的结构保存为PDB文件(可以使用Gromacs的“editconf”工具完成)。然后,使用Gromacs的“g_gyrate”工具计算回旋半径,该工具将输出一个文件,其中包含回旋半径的值。