linux下载sra数据

输入prefetch -c SRR3589958后下载的数据没有.sra的后缀,也没法转变为fastq,求解决方法,感谢

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解决方法:

  1. 使用fastq-dump工具将.sra文件转换为fastq文件:
    fastq-dump --split-files SRR3589958
  2. 使用sratoolkit工具将.sra文件转换为fastq文件:
    fastq-dump --split-files SRR3589958 --outdir <输出目录>

根据错误信息中的链接,SRA已经从HTTP转移到HTTPS,使SRA工具包的所有以前的版本都被淘汰。因此可能原因是下载的SRAtools版本过低,需要更新版本。最后注意硬盘容量。

这里面有4种方法来下载,你可以参照一下
https://blog.csdn.net/qq_42458954/article/details/119939955


真他*的烦上来就让人家采纳的,道德绑架?
题主采不采纳没有自己判断么,还需要你告诉!