关于crud-以下哪种查询方式比较好呢

方式2看起来比较方便，但可能有需要部门信息和不需要部门信息的情况，如果遇到不需要部门信息的情况，关联查询就是多余了吧？

都可以啊 根据需求选择就好了
第一种的话 是对于sql不咋熟悉的人友好，因为只写单表的的查询，这种是根据需要去查询
第二种的话,就是不管你需不需要都给你查出来
另外以后学了mybatis后，你会发现，你喜欢第一种，因为mybatis提供的单表的写好的查询方法，直接调用即可，而如果使用第二种都话，你得写自定义sql了，通用mapper方法是用不了的

一般项目中 1和2都会有吧，1更通用，2性能更快些。像你说的2会有冗余信息，这个时候你完全可以调用 1就可以了。
之所以有很多第二种，是因为第二种只用调用一个方法，调用简单，而第一种需要调用两次方法，而且后面查询部门还得依赖查询user的结果，还得判断user是否存在，再去调用查询部门。