刚开始学数据处理,从SRA下载数据经过trim_galore、fastqc等处理,现在合成的表达矩阵缺失值较多,请问下一般缺失值怎么处理比较合理
可以参考一下jimmy的https://zhuanlan.zhihu.com/p/136021249%EF%BC%8C
我建议是如果是个别基因缺失多那可能是测序问题,剔除即可;如果多个基因缺失多,再重新跑几遍上游分析排除自己处理方法的问题,再根据情况选择填补,参考这篇https://cloud.tencent.com/developer/article/1675094?from=article.detail.1512717