您好，我看见您在生信方面提供了很多专业性的帖子，我目前是在国内读博的植物分子专业的学生，现在在写文章时遇到一个名词概念上的疑问，因为平时不是做这方面的，不是很了解，想请教您一下。主要的问题是我在写文章时在已有的网站PLAZA上对我的基因进行了在不同物种中查找了同源蛋白，但是在给一个外国导师帮忙看的时候，他问我同源蛋白的阈值用的什么，他是对我原文中Sequences of proteins homologous 这个地方批注了一句What are the thresholds used?这个问题我没有看懂，因为我是直接用的网站做的比对，我不知道我这里提供的阈值应该是什么样的参数或者标准，打扰您了，谢谢。